煙堿是煙草重要的品質(zhì)性狀,明確煙堿含量的調(diào)控機(jī)制,篩選特異煙堿含量的煙草品種,對提高煙葉品質(zhì)具有重要的指導(dǎo)意義。然而,直接鑒定煙草種質(zhì)資源的煙堿含量周期很長、效率偏低、消耗大量人力物力,影響了種質(zhì)資源的發(fā)掘利用。而利用分子標(biāo)記開展特異煙堿種質(zhì)的篩選,則能夠有效縮短鑒定周期,節(jié)約成本,極大提高工作效率。近年來,雖有一些煙堿相關(guān)分子標(biāo)記挖掘工作得以開展,但限于分子標(biāo)記密度不高、準(zhǔn)確度不夠等問題,煙堿相關(guān)分子標(biāo)記很少被應(yīng)用到種質(zhì)資源的篩選上。而隨著二代高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展,RAD測序技術(shù)因其所具有的基因組覆蓋均勻、成本低、周期短等特點,得到了廣泛的應(yīng)用。同時,得益于高通量測序技術(shù)的發(fā)展,依賴于SNP標(biāo)記的全基因組關(guān)聯(lián)分析方法迅速發(fā)展為植物復(fù)雜數(shù)量遺傳性狀研究的有效手段。本研究對219份烤煙品種開展了RAD重測序,對29份烤煙品種開展全基因組重測序,結(jié)合全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法,發(fā)掘與煙堿含量變異、煙堿合成關(guān)鍵基因表達(dá)量顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點;同時針對關(guān)聯(lián)位點進(jìn)行相應(yīng)候選基因的預(yù)測,功能標(biāo)記開發(fā)等工作,對煙草煙堿相關(guān)分子標(biāo)記挖掘,高煙堿品種選育等工作具有重要的指導(dǎo)意義。具體研究結(jié)果如下:1.對2...

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.3.1供試材料各年點煙堿含量表型變異分析圖

圖2.3.1供試材料各年點煙堿含量表型變異分析圖Fig.2.3.1Variationanalysisofnicotinecontentfromthetestedmaterialsindifferentyear/s2.3.2供試群體簡化基因組重測序通....

圖2.3.224條染色體的SNP密度分布熱圖

圖2.3.1供試材料各年點煙堿含量表型變異分析圖Fig.2.3.1Variationanalysisofnicotinecontentfromthetestedmaterialsindifferentyear/site2.3.2供試群體簡化基因組重....

圖2.3.3供試群體的N-J聚類樹

國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章烤煙煙堿含量的全基因組關(guān)聯(lián)3.3供試群體遺傳多樣性分析通過計算供試群體的核苷酸多態(tài)性（NucleotidePolymorphism）可知，總?cè)后w的π值04051，π(JC)值為：0.04051；國內(nèi)育成品種的π值為：0.05868，π(JC)....

圖2.3.4煙堿含量全基因組關(guān)聯(lián)分析

國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章烤煙煙堿含量的全基因組關(guān)聯(lián)分2.3.4供試群體SNP變異位點與煙堿含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析在依據(jù)材料與方法2.2.4的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行了數(shù)據(jù)處理后，將供試群體的煙堿含量表型數(shù)據(jù)與S據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。實際進(jìn)入關(guān)聯(lián)分析運算的SNP位點共274,....

本文編號：4054971