對(duì)谷子NBS-LRR類家族成員進(jìn)行鑒定,并對(duì)其染色體分布、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、系統(tǒng)進(jìn)化及表達(dá)水平進(jìn)行分析,為NBS-LRR類家族基因在谷子抗病分子育種中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明,共獲得NBS-LRR類家族基因411個(gè),其中含CN(CC-NBS)結(jié)構(gòu)的基因376個(gè),含CNL(CC-NBS-LRR)結(jié)構(gòu)的基因33個(gè),含TIR(Toll interleukin-1 receptor)結(jié)構(gòu)的基因1個(gè),僅含NBS結(jié)構(gòu)的基因1個(gè)。多數(shù)NBS-LRR類家族基因定位在8號(hào)染色體。在谷子中NBS結(jié)構(gòu)域存在4段保守序列,且該家族在系統(tǒng)進(jìn)化中被分為3類,基因結(jié)構(gòu)多樣,保守基序Motif1結(jié)構(gòu)最保守。有23個(gè)谷子NBS-LRR類基因與狗尾草存在共線性,21個(gè)與水稻存在共線性,僅1個(gè)與擬南芥存在共線性,其中Seita.8G088500和Seita.8G088400被鑒定為水稻抗稻瘟病的高度同源基因。谷子與水稻、擬南芥的共線性基因的Ka/Ks值均小于1;與狗尾草的共線性基因中,Seita.6G014500、Seita.6G023500的Ka/Ks值均大于1。表達(dá)譜分析表明,在谷子根和穗中高表達(dá)的NBS-LRR類基...

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圖2 谷子NBS結(jié)構(gòu)序列特征分析

對(duì)NBS-LRR類家族基因的表達(dá)情況進(jìn)行分析(圖7)發(fā)現(xiàn),除13個(gè)基因(Seita.8G136700、Seita.3G400800、Seita.4G250500、Seita.4G244400、Seita.8G244000、Seita.4G244000、Seita.6G021300....

圖1 谷子NBS-LRR類家族成員基因染色體定位

選擇谷子中長(zhǎng)度完整的80個(gè)NBS-LRR類家族基因進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析及Motif預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,有8個(gè)基因無UTR區(qū),其余均存在UTR區(qū),有36個(gè)基因存在2段NBS區(qū)域(圖4A—B)。對(duì)80條NBS-LRR類基因編碼氨基酸序列進(jìn)行Motif預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),其含有8個(gè)Motif,較保守的M....

圖3 谷子NBS-LRR類基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹

圖2谷子NBS結(jié)構(gòu)序列特征分析圖4谷子部分NBS-LRR類基因的進(jìn)化(A)、基因結(jié)構(gòu)(B)及Motif分析(C)

圖4 谷子部分NBS-LRR類基因的進(jìn)化 (A)、基因結(jié)構(gòu) (B)及Motif分析 (C)

圖3谷子NBS-LRR類基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹圖5谷子NBS-LRR類家族基因Motif結(jié)構(gòu)分析

本文編號(hào)：4055350