基于核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)基因的9種蚊蟲分子鑒定
發(fā)布時(shí)間:2020-12-09 12:51
目的分析常見9種蚊蟲核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(rDNA-ITS2)基因序列特征,為蚊蟲種類分子鑒定方法探討提供依據(jù)。方法在山東省濟(jì)寧市采集淡色庫(kù)蚊、三帶喙庫(kù)蚊、二帶喙庫(kù)蚊、白紋伊蚊、刺擾伊蚊、中華按蚊、騷擾阿蚊、常型曼蚊和黃色柯蚊成蚊,形態(tài)學(xué)種類鑒定后,提取上述9種蚊蟲DNA,PCR擴(kuò)增rDNA-ITS2基因并測(cè)序;在GenBank中進(jìn)行同源性比對(duì),采用Bioedit 7.0軟件及DNAMAN軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)分析,通過DNASTAR、ClustalX 1.81和Mega6軟件分析列特征并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹探討系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。結(jié)果 9種蚊蟲的rDNAITS2長(zhǎng)度在343 bp與577 bp之間,共有59個(gè)保守位點(diǎn)、449個(gè)變異位點(diǎn)、235個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)和191個(gè)單態(tài)位點(diǎn),9種蚊蟲種間序列同源性為28.21%~53.76%;所有蚊蟲的rDNA-ITS2基因分子鑒定與形態(tài)學(xué)鑒定吻合率100%,庫(kù)蚊屬的淡色庫(kù)蚊、三帶喙庫(kù)蚊和二帶喙庫(kù)蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,不同種蚊蟲為獨(dú)立分支。結(jié)論核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔(rDNA-ITS2)基因可用于蚊蟲屬和種的鑒定。
【文章來源】:熱帶病與寄生蟲學(xué). 2020年01期 第12-16頁
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
9種蚊種的r DNA-ITS2基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果
采用NJ法和UPGMA法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,所有系統(tǒng)數(shù)樹支上數(shù)值為1 000次Bootstrap檢測(cè)得到的對(duì)該支的支持百分?jǐn)?shù)。從圖中可以看出這兩種不同的分子系統(tǒng)樹具有大致相同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),庫(kù)蚊屬的淡色庫(kù)蚊、三帶喙庫(kù)蚊和二帶喙庫(kù)蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,但這兩個(gè)系統(tǒng)中,騷擾阿蚊、黃色柯蚊、常型曼蚊和中華按蚊的位置有所不同。在NJ樹中,該四種蚊蟲為獨(dú)立分支,而UPGMA樹中,騷擾阿蚊和黃色柯蚊聚為一類(圖2)。討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]9種蚊蟲細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因的分子進(jìn)化分析[J]. 郭秀霞,程鵬,劉麗娟,史琦琪,王海防,張崇星,王懷位,公茂慶. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2017(06)
[2]山東省淡色庫(kù)蚊核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)基因多態(tài)性分析[J]. 劉飛,郭秀霞,程鵬,王海防,劉麗娟,楊培培,趙玉強(qiáng),王懷位,公茂慶. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2015(06)
[3]核糖體DNA序列分析在昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 江世宏,孟子燁,陳曉琴,李廣京. 昆蟲分類學(xué)報(bào). 2008(03)
[4]廣東國(guó)境口岸五種蚊種核糖體基因第2內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)分子鑒定方法研究[J]. 師永霞,幸蘆琴,洪燁,李小波,郭波旋,相大鵬,黃吉城,鄭夔. 中國(guó)國(guó)境衛(wèi)生檢疫雜志. 2008(01)
[5]一種簡(jiǎn)便的赫坎按蚊復(fù)合體近緣種按蚊基因鑒別新技術(shù)[J]. 高琪,周華云,Cooper R.D,李鳳華,蘇云普,朱國(guó)鼎,曹俊,Beebe N.W. 中國(guó)人獸共患病雜志. 2005(03)
[6]不同蚊種核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)的PCR擴(kuò)增[J]. 徐建農(nóng),瞿逢伊,董學(xué)書. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 1996(02)
本文編號(hào):2906889
【文章來源】:熱帶病與寄生蟲學(xué). 2020年01期 第12-16頁
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
9種蚊種的r DNA-ITS2基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果
采用NJ法和UPGMA法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,所有系統(tǒng)數(shù)樹支上數(shù)值為1 000次Bootstrap檢測(cè)得到的對(duì)該支的支持百分?jǐn)?shù)。從圖中可以看出這兩種不同的分子系統(tǒng)樹具有大致相同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),庫(kù)蚊屬的淡色庫(kù)蚊、三帶喙庫(kù)蚊和二帶喙庫(kù)蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,但這兩個(gè)系統(tǒng)中,騷擾阿蚊、黃色柯蚊、常型曼蚊和中華按蚊的位置有所不同。在NJ樹中,該四種蚊蟲為獨(dú)立分支,而UPGMA樹中,騷擾阿蚊和黃色柯蚊聚為一類(圖2)。討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]9種蚊蟲細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因的分子進(jìn)化分析[J]. 郭秀霞,程鵬,劉麗娟,史琦琪,王海防,張崇星,王懷位,公茂慶. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2017(06)
[2]山東省淡色庫(kù)蚊核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)基因多態(tài)性分析[J]. 劉飛,郭秀霞,程鵬,王海防,劉麗娟,楊培培,趙玉強(qiáng),王懷位,公茂慶. 中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志. 2015(06)
[3]核糖體DNA序列分析在昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 江世宏,孟子燁,陳曉琴,李廣京. 昆蟲分類學(xué)報(bào). 2008(03)
[4]廣東國(guó)境口岸五種蚊種核糖體基因第2內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)分子鑒定方法研究[J]. 師永霞,幸蘆琴,洪燁,李小波,郭波旋,相大鵬,黃吉城,鄭夔. 中國(guó)國(guó)境衛(wèi)生檢疫雜志. 2008(01)
[5]一種簡(jiǎn)便的赫坎按蚊復(fù)合體近緣種按蚊基因鑒別新技術(shù)[J]. 高琪,周華云,Cooper R.D,李鳳華,蘇云普,朱國(guó)鼎,曹俊,Beebe N.W. 中國(guó)人獸共患病雜志. 2005(03)
[6]不同蚊種核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)的PCR擴(kuò)增[J]. 徐建農(nóng),瞿逢伊,董學(xué)書. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 1996(02)
本文編號(hào):2906889
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