【摘要】：目的:通過高通量測序技術(shù)研究分析早期食管鱗狀上皮細胞癌(Early esophageal squamous cell carcinoma,EESCC)人群食管黏膜微生態(tài)構(gòu)成特點。方法:采用前瞻性隨機對照的研究方法,在2017年06月至2017年12月期間,對符合入組標準的健康對照(Health control)人群(HC組,n=15)及早期食管鱗狀上皮細胞癌患者(EESCC組,n=15)食管粘膜標本進行收集,并行高通量測序及生物信息學處理,對比兩組人群的食管黏膜微生態(tài)結(jié)構(gòu)特點。結(jié)果:本研究共納入30名研究對象,其中HC組15例,在我院手術(shù)并經(jīng)病理證實為EESCC患者15例。生物信息學顯示,HC組中兩例樣本測序深度不滿足生物信息學分析要求予以剔除。EESCC組的平均可操作分類單元(Operational taxonomic units,OTUs)數(shù)明顯高于HC組(1241.0±445.7vs885.2±212.9,P=0.014)。在門分類水平,EESCC組廣古菌門、Kazan-3B-28門相對豐富度高于HC組(P0.05),厚壁菌門的相對豐富度則低于HC組(P0.05)。在屬分類水平,EESCC組阿克曼腸道菌屬、叢毛單胞菌屬、寡養(yǎng)單胞菌屬、紫單胞菌屬、腸桿菌屬的相對豐富度均高于HC組(P0.05),而EESCC組普氏菌屬、羅氏菌屬、韋榮球菌屬、鏈球菌屬、蒼白桿菌屬、巨型球菌屬、腸球菌屬、熱桿菌屬、雙歧桿菌屬的相對豐富度低(P0.05)。主成份分析(Principal component analysis,PCA)、主坐標分析(Principal coordinates analysis,PCoA)與非度量多維尺度分析(Non-metric multidimensional scaling,NMDS)結(jié)果顯示EESCC組與HC組菌群結(jié)構(gòu)多樣性存在顯著差異(P0.05)。LDA Effect Size分析提示,與HC組對比,EESCC組主要特征菌群為叢毛單胞菌屬、腸桿菌屬。結(jié)論:EESCC組主要特征菌群為叢毛單胞菌屬、腸桿菌屬,其食管黏膜微生物菌群物種多樣性高于HC組,菌群構(gòu)成與健康人群存在顯著差異,考慮食管黏膜菌群變化可能與EESCC的發(fā)生存在一定關系。
【圖文】：

EESCC組 HC組圖3.1 EESCC組與HC組平均OTU數(shù)值對比后我們根據(jù)HC組和EESCC組食管黏膜樣品中OTU數(shù)目制成韋恩圖，藍CC組，橙色代表HC組，我們可以直觀的發(fā)現(xiàn)，EESCC組存在的OTU有C組存在2971種，其中EESCC與HC組共有的物種數(shù)目為2487種（圖3.2

圖3.3 Rarefaction稀釋曲線圖 圖3.4 Shannon-Wiener曲線圖3.5 Simpson稀釋曲線3.2.3 α多樣性分析我們通過ACE、Chao1、Observed species曲線用來反映樣品內(nèi)的微生物群落的豐富度，Shannon和Simpson曲線反映樣品內(nèi)多樣性，通過分析比較我們可以得出EESCC組微生物菌群物種豐富度高于HC組(圖3.6)。
【學位授予單位】：福建醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R735.1

【參考文獻】

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1 陳衛(wèi)剛;楊春梅;徐麗紅;張寧;劉曉燕;馬云貴;霍曉玲;韓玉勝;田德安;鄭勇;;Gene Chip Technology Used in the Detection of HPV Infection in Esophageal Cancer of Kazakh Chinese in Xinjiang Province[J];Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences);2014年03期

2 Luís Carlos Moreira Antunes;Joo Carlos Prolla;Antonio de Barros Lopes;Marta Pires da Rocha;Renato Borges Fagundes;;No evidence of HPV DNA in esophageal squamous cell carcinoma in a population of Southern Brazil[J];World Journal of Gastroenterology;2013年39期

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1 林英英;食管菌群與食管癌的關系[D];福建醫(yī)科大學;2016年

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本文編號：2646868