【目的】明確不同地區(qū)沙田柚果園土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性,為沙田柚栽培的精準(zhǔn)管理提供參考�！痉椒ā恳�5省(市)7縣沙田柚果園土壤為研究對象,測定土壤理化性質(zhì),應(yīng)用高通量測序研究其多樣性及群落結(jié)構(gòu)。【結(jié)果】研究合計(jì)獲得可用于物種分類的OTUs 10 713條,至少涵蓋60門,68綱,147目,275科,658屬;多樣性分析表明,長壽的樣本多樣性最低,連山的樣本多樣性最高;變形菌門是所有樣本中的優(yōu)勢菌門;Sphingomonas sp.是沙田柚栽培產(chǎn)區(qū)潛在的致病小種;對土壤理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),不同來源的樣本土壤理化性質(zhì)差異較大;冗余分析發(fā)現(xiàn),80.55%的群落變化可以被選取的環(huán)境因素所解釋。【結(jié)論】硝態(tài)氮、無機(jī)磷、速效鉀3個(gè)因素是影響細(xì)菌α多樣性的主要因素,不同區(qū)域的沙田柚果園細(xì)菌種群不同。

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【部分圖文】：

圖1 取樣點(diǎn)分布圖

采用SDS法提取土壤總DNA，瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的純度和濃度后，將稀釋DNA濃度稀釋至樣本，終濃度為1ng/μL。擴(kuò)增引物使用帶Barcode的細(xì)菌16SrDNA-V4區(qū)特異引物（515F和806R，引物序列分別為GTGCCAGCMGCCGCGGTAA和GGACTAC....

圖2 各樣本的稀釋曲線

利用花瓣圖分析均一化處理后的各組樣本之間共有、特有的OTUs。如圖所示，合計(jì)969個(gè)OTUs為7個(gè)不同地區(qū)沙田柚果園所共有，特有OTUs最多的是連山的樣品，特有OUTs數(shù)為645；最少的是長壽的樣本，特有OTUs數(shù)為190（圖3）。圖3OTU分布圖

圖3 OTU分布圖

圖2各樣本的稀釋曲線在97%一致性閾值下對7組樣本的AlphaDiversity分析指數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，結(jié)果如表1所示。本研究中，所有微生物群落多樣性和豐富度的指標(biāo)中來自江永的樣本最高，來自長壽的樣本最低。

圖4 不同地區(qū)沙田柚果園土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的主坐標(biāo)分析

在門分類水平對7組樣本進(jìn)行分析，樣本細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在門分類水平具有較高的多樣性，對于不同樣本來說，來自長壽的樣本分離到的門數(shù)目最少，為33個(gè)；連山的最多，為49個(gè)。這些門主要包括變形菌門（Proteobacteria），不同樣本的相對豐度在33.61%～40.87%之間；厚壁菌門（....

本文編號：4054496