成纖維細胞生長因子（Fibroblast Growth Factors, FGFs）是一類小型分泌多肽生長因子,被證明參與到各種各樣重要的生物學進程中,如生長、發(fā)育、性別決定與分化、細胞分化、增殖、遷移、凋亡等。迄今為止,哺乳動物中己分離到的FGF成員有22個（FGF1-23,人類FGF19是小鼠FGF15的直系同源基因）,斑馬魚中有27個,而在其他物種還沒有詳細完整的報道。目前對FGF的功能特別是在性別決定與分化過程中作用的研究主要集中于哺乳動物,而魚類中只有少量報道,為了研究FGF家族成員在魚類性別決定與分化以及性腺發(fā)育過程中的潛在作用,我們從基因組水平以及轉(zhuǎn)錄組水平對新近完成基因組測序的尼羅羅非魚的FGF家族成員進行了系統(tǒng)分析,并對FGF9/16/20亞家族在性腺發(fā)育中的可能作用進行了探討。本研究通過同源搜索比對,結(jié)合基因組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在尼羅羅非魚中分離到了33個成員。其中7個（1b、FGF4b、FGF11b、FGF12b、FGF13b、FGF14b、FGF23b）為首次發(fā)現(xiàn)。根據(jù)分離到的尼羅羅非魚FGF序列,還在三棘刺魚、青鳉、紅鰭東方鲀、黑青斑河豚以及新近完成基因組測序的另外... 

【文章來源】：西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 文獻綜述
    1、FGF家族成員
    2、FGF家族成員的結(jié)構
    3、FGF家族進化
    4、FGF家族基因功能
        4.1 FGF1/2亞家族
        4.2 FGF3/7/10/22亞家族
        4.3 FGF4/5/6亞家族
        4.4 FGF8/17/18亞家族
        4.5 FGF9/16/20亞家族
        4.6 FGF11/12/13/14亞家族
        4.7 FGF19/21/23亞家族
    5、本研究的立項依據(jù)和目的意義
第2章 尼羅羅非魚FGF家族成員的分離及生物信息學分析
    1、前言
    2、材料與方法
        2.1 五種麗魚科魚類基因組本地BLAST數(shù)據(jù)庫的構建
        2.2 尼羅羅非魚FGF家族成員基因序列的分離
        2.3 尼羅羅非魚FGF家族成員系統(tǒng)進化分析
        2.4 尼羅羅非魚與人類FGF基因共線性分析
    3、實驗結(jié)果
        3.1 尼羅羅非魚FGF家族序列分析
        3.2 尼羅羅非魚FGF家族系統(tǒng)進化分析
        3.3 尼羅羅非魚FGF基因家族共線性分析
        3.4 尼羅羅非魚FGF家族基因性腺轉(zhuǎn)錄組分析
    4、討論
第3章 尼羅羅非魚FGF9/16/20亞家族成員的分子克隆及功能的初步研究
    1、前言
    2、材料與方法
        2.1 實驗動物
        2.2 試劑、耗材和儀器
        2.3 有關試劑的配制
        2.4 藥物處理
        2.5 尼羅羅非魚FGF16以及兩個FGF20同源基因的克隆
        2.6 系統(tǒng)發(fā)生和共線性分析
        2.7 尼羅羅非魚FGF16、FGF20a、FGF20b表達模式分析
        2.8 性腺發(fā)育過程中FGF16和FGF20b的表達以及性逆轉(zhuǎn)對其表達的影響#41
        2.9 原位雜交（In situ hybridization,ISH）
    3、實驗結(jié)果
        3.1 序列及系統(tǒng)發(fā)生分析
        3.2 共線性分析
        3.3 組織表達模式分析
        3.4 尼羅羅非魚性腺發(fā)育過程中FGF16和FGF20b mRNA的表達
        3.5 藥物處理誘導性逆轉(zhuǎn)對FGF16和FGF20表達的影響
        3.6 FGF16和FGF20b在性腺表達的細胞類型
    4、討論
結(jié)論
參考文獻
致謝
在讀期間所發(fā)表的文章
專利申請情況
在讀期間參加科研情況



本文編號：2904007