單鏈結(jié)合蛋白（Single-strand DNA binding protein,SSB）可以以很高的親和力結(jié)合單鏈DNA（ssDNA）,并可以與許多DNA代謝相關(guān)蛋白發(fā)生相互作用,從而起到保護(hù)ssDNA產(chǎn)物不被降解,并介導(dǎo)代謝相關(guān)蛋白進(jìn)入相應(yīng)位置進(jìn)行反應(yīng)的功能。大腸桿菌單鏈結(jié)合蛋白（E-coli SSB）是單鏈結(jié)合蛋白中具有代表性的一種,它是一種同源四聚體,每個(gè)亞基都可以和ssDNA產(chǎn)生高度親和力并結(jié)合。大腸桿菌SSB存在三種穩(wěn)定的結(jié)合模式,分別結(jié)合65 nt ssDNA、56 nt ssDNA和35 nt ssDNA,分別在不同鹽離子濃度下存在。許多研究者對(duì)大腸桿菌SSB這一現(xiàn)象進(jìn)行了大量的研究,然而,其反應(yīng)的具體過程以及相關(guān)反應(yīng)系數(shù)仍然沒有被全部揭示。因此,我們利用單分子動(dòng)力學(xué)的方法,結(jié)合單分子磁鑷進(jìn)行拉力實(shí)驗(yàn),觀察SSB在拉力下的反應(yīng)現(xiàn)象,發(fā)現(xiàn)在某個(gè)臨界力下,SSB會(huì)發(fā)生跳變式結(jié)合/解離現(xiàn)象。我們對(duì)這個(gè)現(xiàn)象進(jìn)行了長時(shí)間測量,得出其反應(yīng)系數(shù)以及相應(yīng)的自由能參數(shù)。我們通過對(duì)自由能的修正,還原了拉力為零時(shí)大腸桿菌SSB的結(jié)合過程,發(fā)現(xiàn)它是一個(gè)由快速地結(jié)合和緩慢地纏繞相組合的過程,表現(xiàn)... 

【文章來源】：中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院物理研究所)北京市

【文章頁數(shù)】：98 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

光鑷裝置示意圖(2)

第1章 前言折射率介質(zhì)的光，當(dāng)入射角增大至某一閾值時(shí)，會(huì)發(fā)生全內(nèi)反射。當(dāng)射時(shí)，雖然光線全部反射，但在入射界面低折射率介質(zhì)中會(huì)形成一個(gè)瞬逝場。瞬逝場從界面向低折射率介質(zhì)內(nèi)部傳播距離極短，通常只有或更小，它的場強(qiáng)度存在以下關(guān)系(13)。( ) (0) exp( )zI z Id 2 2 21 24 sindn n I(z)為場強(qiáng)度，z 為垂直于入射表面的深度值，d 是穿透深度，由光

在使用中，一般會(huì)使用手柄分子一端連接順磁性物質(zhì)包裹的聚苯乙通過移動(dòng)或旋轉(zhuǎn)磁鐵可以改變外磁實(shí)現(xiàn)對(duì)手柄分子的拉伸與扭轉(zhuǎn)(25)。磁力的大小可以由下面公式描述xdBF mdx Bx/dx 為磁場梯度。在實(shí)驗(yàn)中，可以用 2BkTLF x 圖 1.4 磁鑷裝置示意圖(2)Fig 1.4 Diagram of magnetic tweeze


本文編號(hào)：2897219