SVC是由SVCV引起的一種重要的病毒性傳染疾病,可引起多種鯉科魚(yú)類嚴(yán)重的出血癥狀以及死亡現(xiàn)象,給養(yǎng)殖業(yè)造成了重大損失。TRIM家族蛋白具有多種生物學(xué)功能,其抗病毒活性引起較多關(guān)注。本研究擬從天然免疫角度探究TRIM47對(duì)SVCV的作用,以及采用RNA測(cè)序手段探究SVCV與其宿主的相互作用機(jī)制,為發(fā)現(xiàn)更多SVCV靶標(biāo)奠定的理論基礎(chǔ)。具體研究?jī)?nèi)容如下:一、鯉TRIM47生物特性分析及功能初步探究1)對(duì)TRIM47的序列特征進(jìn)行比對(duì)和聚類分析,以及對(duì)鯉TRIM47的時(shí)空分布進(jìn)行檢測(cè);2)體外SVCV感染可以顯著抑制TRIM47 mRNA水平,但不影響TRIM47蛋白水平;3)TRIM47體外真核表達(dá)呈均勻點(diǎn)狀分布在細(xì)胞質(zhì),亞細(xì)胞定位顯示TRIM47部分定位在線粒體上;4)過(guò)表達(dá)TRIM47可以顯著抑制SVCV-G mRNA的合成,在SVCV刺激下可顯著上調(diào)IFN1 mRNA水平。二、SVCV感染斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)錄組分析1)模擬自然感染的溫度條件,將水溫控制在17℃,斑馬魚(yú)腹腔注射SVCV,獲得了良好的感染模型;2)SVCV感染斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)錄組分析,在腦中檢測(cè)到382個(gè)差異基因、脾中926個(gè)差異基因;3)...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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圖1-1病毒及其基因組示意圖（Ashrafetal.2016）

圖1-1病毒及其基因組示意圖（Ashrafetal.2016）（a）病毒粒子結(jié)構(gòu)；（b）病毒基因組結(jié)構(gòu)Fig.1-1SchematicofSVCVanditsgenome(Ashrafetal.2016)(a)Modelofviralstru....

圖1-2TRIM/RBCC家族結(jié)構(gòu)特征示意圖（MeroniandDiez-Roux2005）

圖1-2TRIM/RBCC家族結(jié)構(gòu)特征示意圖（MeroniandDiez-Roux2005）IM蛋白結(jié)構(gòu)域模式圖；（B）RING、B-box1和B-box2的化學(xué)結(jié)構(gòu)式；（C）構(gòu)域的種類Schematicofthedomainstructureof....

圖4-1TRIM47基因PCR擴(kuò)增（A）包含TRIM47CDS的序列擴(kuò)增；（B）TRIM47擴(kuò)增片段回收；（C）載體及TRIM47酶切后凝膠電泳回收

圖4-1TRIM47基因PCR擴(kuò)增（A）包含TRIM47CDS的序列擴(kuò)增；（B）TRIM47擴(kuò)增片段回收；（C）載體及TRIM47酶后凝膠電泳回收Fig.4-1ThePCRamplificationofTRIM47

圖4-2TRIM47氨基酸序列比對(duì)斑馬魚(yú)、鯉、人類，鼠TRIM47氨基酸序列比對(duì)結(jié)果，其中高度保守的RING、B-box和PRY/SPRY（B30.2）結(jié)構(gòu)域用粗線加以標(biāo)注

圖4-2TRIM47氨基酸序列比對(duì)斑馬魚(yú)、鯉、人類，鼠TRIM47氨基酸序列比對(duì)結(jié)果，其中高度保守的RING、B-box和PRY/SP（B30.2）結(jié)構(gòu)域用粗線加以標(biāo)注Fig.4-2AminoacidalimentsofTRIM47

本文編號(hào)：4043591