不同山羊品種朊蛋白基因多態(tài)性及其與血液免疫性狀的關聯(lián)分析
發(fā)布時間:2025-03-19 05:56
朊蛋白基因(PRNP)是調(diào)控朊蛋白表達的重要基因,存在高度的變異性,研究發(fā)現(xiàn)山羊PRNP基因編碼區(qū)存在10個氨基酸變異位點(102,127,143,146,154,211,218,219,222和240)和三個同義代替位點(42,125和138),PRNP基因位于山羊13號染色體,研究發(fā)現(xiàn)山羊PRNP基因遺傳多樣性與癢病的抗病性/易感性顯著相關。本試驗以山東省規(guī);窖蝠B(yǎng)殖場為試驗羊只,共采集851只山羊的血樣,包括3個品種即魯波山羊464只、萊蕪黑山羊131只和嶗山奶山羊256只,按年齡分為三組即1歲以下組、1歲-2歲組和2歲以上組。采取的技術路線是:首先,選取60只魯波山羊提取DNA、設計引物和混池測序,找出所研究群體中該基因可能存在的多態(tài)性位點;對每只山羊的DNA樣品進行測序,利用Chromas 2按照測序峰圖再為每個多態(tài)位點進行基因型判定;用Pop Gen 32和SPSS 22分析PRNP基因多態(tài)位點和品種等對血液性狀的效應值,找出與血液性狀有關聯(lián)的優(yōu)勢基因型。試驗結(jié)果如下:1、在所研究群體中共發(fā)現(xiàn)11個SNP多態(tài)位點,其中有3個SNP位點(NH1、NH2和3’UTR)為首次發(fā)現(xiàn)...
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
英文縮略詞
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的特點
1.1.1 魯波山羊的特點
1.1.2 嶗山奶山羊的特點
1.1.3 萊蕪黑山羊的特點
1.1.4 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的抗病性狀
1.2 PRNP基因的研究進展
1.3 朊蛋白
1.3.1 朊蛋白基因和蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 朊蛋白基因的表達調(diào)控
1.4 PRNP基因與山羊、綿羊癢病
1.4.1 癢病研究進展
1.4.2 PRNP基因與綿羊癢病
1.4.3 PRNP基因與山羊癢病
1.5 目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗樣品的采集
2.1.2 試驗儀器設備
2.1.3 試驗試劑及來源
2.1.4 主要數(shù)據(jù)庫及生物學軟件
2.1.5 常用試劑配制
2.2 試驗方法
2.2.1 血常規(guī)的測定
2.2.2 血液基因組DNA的提取
2.2.3 PRNP基因的克隆及多態(tài)性分析
3 結(jié)果與分析
3.1 混池測序結(jié)果以及基因分型
3.1.1 混池測序結(jié)果
3.1.2 混池測序基因分型
3.2 不同山羊所有位點等位基因及基因型頻率
3.3 血常規(guī)測定結(jié)果
3.4 血液基因組DNA提取結(jié)果
3.5 三個品種山羊的所有位點多態(tài)性分析
3.5.1 三個品種山羊的所有位點遺傳變異統(tǒng)計值
3.5.2 三個品種山羊的所有位點雜合度統(tǒng)計值
3.5.3 三個品種山羊的所有位點F-統(tǒng)計量和基因流統(tǒng)計值
3.5.4 三個品種山羊之間Nei氏遺傳相似度和遺傳距離
3.6 不同因素與各項血液指標之間的顯著性分析
3.7 品種和年齡與不同位點兩兩交互作用與各項血液指標之間的顯著性分析
4 討論
4.1 篩選目的片段
4.2 不同山羊?qū)ρ虬W病的易感性
4.3 不同山羊品種內(nèi)與品種間的遺傳距離
4.4 血液免疫指標與機體抗病力的關系
4.5 不同因素與血液免疫指標的關系
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
本文編號:4036770
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【學位級別】:碩士
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英文縮略詞
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的特點
1.1.1 魯波山羊的特點
1.1.2 嶗山奶山羊的特點
1.1.3 萊蕪黑山羊的特點
1.1.4 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的抗病性狀
1.2 PRNP基因的研究進展
1.3 朊蛋白
1.3.1 朊蛋白基因和蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 朊蛋白基因的表達調(diào)控
1.4 PRNP基因與山羊、綿羊癢病
1.4.1 癢病研究進展
1.4.2 PRNP基因與綿羊癢病
1.4.3 PRNP基因與山羊癢病
1.5 目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗樣品的采集
2.1.2 試驗儀器設備
2.1.3 試驗試劑及來源
2.1.4 主要數(shù)據(jù)庫及生物學軟件
2.1.5 常用試劑配制
2.2 試驗方法
2.2.1 血常規(guī)的測定
2.2.2 血液基因組DNA的提取
2.2.3 PRNP基因的克隆及多態(tài)性分析
3 結(jié)果與分析
3.1 混池測序結(jié)果以及基因分型
3.1.1 混池測序結(jié)果
3.1.2 混池測序基因分型
3.2 不同山羊所有位點等位基因及基因型頻率
3.3 血常規(guī)測定結(jié)果
3.4 血液基因組DNA提取結(jié)果
3.5 三個品種山羊的所有位點多態(tài)性分析
3.5.1 三個品種山羊的所有位點遺傳變異統(tǒng)計值
3.5.2 三個品種山羊的所有位點雜合度統(tǒng)計值
3.5.3 三個品種山羊的所有位點F-統(tǒng)計量和基因流統(tǒng)計值
3.5.4 三個品種山羊之間Nei氏遺傳相似度和遺傳距離
3.6 不同因素與各項血液指標之間的顯著性分析
3.7 品種和年齡與不同位點兩兩交互作用與各項血液指標之間的顯著性分析
4 討論
4.1 篩選目的片段
4.2 不同山羊?qū)ρ虬W病的易感性
4.3 不同山羊品種內(nèi)與品種間的遺傳距離
4.4 血液免疫指標與機體抗病力的關系
4.5 不同因素與血液免疫指標的關系
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
本文編號:4036770
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