發(fā)布時間：2025-02-11 12:58

　　 密碼子偏好性廣泛存在于各種植物中。本研究利用Codon W和在線軟件CUSP分析西南樺(Betula alnoides)葉綠體基因組中的45條蛋白編碼序列。結果顯示,西南樺葉綠體基因組的ENC值在36.86～56.10之間,密碼子第3位上的GC含量為27.80%,RSCU>1的密碼子中有23個以A或U作為結尾,說明其密碼子偏好以AU結尾;ENC與密碼子第3位堿基的GC含量呈顯著相關;3種圖形分析均表明西南樺葉綠體基因組密碼子偏好性受突變影響較大;最優(yōu)密碼子以C結尾的有7個,G結尾的有2個,U結尾的有1個。本研究為西南樺無性系地理種源鑒定、保持種源多樣性提供了科學依據(jù)。

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【部分圖文】：

圖1 中性繪圖分析

ENC-plot分析顯示(圖2;圖3)，部分基因在或沿標準曲線分布，部分基因位于標準曲線下方較遠的位置，這些基因中部分基因的實際ENC值與預期ENC值接近，而另一部分基因與預期ENC值存在一定的偏離；ENC比值((預期ENC-實際ENC)/預期ENC)的頻數(shù)分布表能更直觀地表示距....

圖2 ENC-plot分析

圖1中性繪圖分析圖3PR2-plot繪圖分析

圖3 PR2-plot繪圖分析

圖2ENC-plot分析1.4PR2-plot繪圖分析

本文編號：4033298