基于榧樹(Torreya grandis)基因組DNA測序數(shù)據(jù)開發(fā)SSR分子標(biāo)記,利用MISA和Primer 3.0腳本設(shè)計SSR引物,從中選擇合成20對SSR引物并在10個榧樹品種中進行多態(tài)性擴增,其中6對引物成功擴增并鑒定到多態(tài)性,各個位點的等位基因數(shù)量介于4～9個之間,平均等位基因數(shù)約為6個,多態(tài)信息含量PIC平均值為1.779 2。本研究開發(fā)的SSR引物能為榧樹遺傳多樣性研究、品種指紋圖譜構(gòu)建提供依據(jù)。

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圖1 基于SSR分子標(biāo)記分型產(chǎn)生的10份榧樹試材聚類樹

基于6對SSR引物的分型結(jié)果并采用UPGMA法構(gòu)建10個榧樹品種的遺傳親緣關(guān)系聚類樹(圖1)。當(dāng)遺傳相似系數(shù)約為0.73時,可將所有試材分為3個組。A組包含有4個榧樹品種,其中包括細榧和茄榧。B組和C組分別包含有3個榧樹品種,其中,B組包括著名榧樹類型珍珠榧和兩個榧樹雄株,意味著....

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