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湖南省部分地區(qū)中華竹鼠畢氏腸微孢子蟲基因分型研究

發(fā)布時(shí)間:2025-04-26 22:34
   為了明確湖南省部分地區(qū)中華竹鼠畢氏腸微孢子蟲的感染情況,從湖南省4個(gè)市的6個(gè)養(yǎng)殖場共采集中華竹鼠新鮮糞便樣品480份,利用小亞基核糖體RNA(SSU rRNA)基因的套式PCR對這些樣品中畢氏腸微孢子蟲的感染率和遺傳多樣性進(jìn)行研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn),25份糞便樣品存在畢氏腸微孢子蟲感染,總感染率為5.2%,除吉首市的中華竹鼠未檢出陽性外,其余各采樣點(diǎn)及各年齡段的中華竹鼠均有畢氏腸微孢子蟲感染,但感染率差異不顯著(P>0.05);進(jìn)一步序列分析發(fā)現(xiàn),所檢測的中華竹鼠畢氏腸微孢子蟲存在2種SSU rRNA基因型(Type 1和Type 2),其中Type 1為優(yōu)勢基因型;多位點(diǎn)序列分析發(fā)現(xiàn),在MS1、MS3、MS7基因位點(diǎn)分別有7、1、14份樣品成功擴(kuò)增,呈現(xiàn)7、1、4個(gè)單倍型。本研究結(jié)果將為湖南省部分地區(qū)中華竹鼠微孢子蟲病的防控提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

圖1 畢氏腸微孢子蟲SSU rRNA基因套氏PCR擴(kuò)增結(jié)果

圖1 畢氏腸微孢子蟲SSU rRNA基因套氏PCR擴(kuò)增結(jié)果

對本研究獲得的25份SSUrRNA基因陽性分離株進(jìn)行序列分析發(fā)現(xiàn),存在2種基因型,分別命名為Type1和Type2。2種基因型序列高度相似,僅存在一個(gè)單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),即在149位存在G/T顛換。Type....


圖2 畢氏腸微孢子蟲在MS1、MS3和MS7位點(diǎn)的套氏PCR擴(kuò)增

圖2 畢氏腸微孢子蟲在MS1、MS3和MS7位點(diǎn)的套氏PCR擴(kuò)增

對25份SSUrRNA基因陽性分離株進(jìn)行MLST分析發(fā)現(xiàn),7、1、14份樣品分別在MS1、MS3、MS7基因位點(diǎn)擴(kuò)增成功,目的片段大小分別為676、537、471bp,且3個(gè)基因位點(diǎn)分別存在7、1和4個(gè)單倍型(圖2和表2)。3討論



本文編號:4041466

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