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疊氮溴化丙錠結(jié)合熒光定量PCR測定布魯氏菌活菌數(shù)方法的建立

發(fā)布時間:2025-05-01 09:06
   為簡便、快速測定宿主體內(nèi)或細(xì)胞內(nèi)布魯氏菌的活菌數(shù),本研究以布魯氏菌單拷貝bcsp31基因?yàn)闄z測靶標(biāo),設(shè)計特異性引物,經(jīng)優(yōu)化反應(yīng)條件及疊氮溴化丙錠(PMA)最佳使用濃度與曝光時間,建立了一種測定布魯氏菌活菌數(shù)的疊氮溴化丙錠--熒光定量PCR方法(PMA-qPCR),并評估了該方法的特異性、敏感性、重復(fù)性。結(jié)果顯示,建立的qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線Ct值與質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品拷貝數(shù)對數(shù)值之間線性關(guān)系良好;特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法對布魯氏菌S2株擴(kuò)增結(jié)果為陽性,對大腸桿菌、沙門氏菌、小腸結(jié)腸炎耶氏菌、副溶血弧菌擴(kuò)增結(jié)果均為陰性;其對布魯氏菌S2的檢測限為10~3cfu/mL,比常規(guī)PCR方法敏感性高100倍;重復(fù)性試驗(yàn)結(jié)果顯示,批間及批內(nèi)重復(fù)試驗(yàn)的變異系數(shù)均為0.63%~2.04%,重復(fù)性好。利用該方法對不同比例布魯氏菌S2活菌/死菌混合樣品定量測定,結(jié)果顯示隨活菌比例的增大,測得的活菌數(shù)與常規(guī)qPCR測定值越接近,表明經(jīng)優(yōu)化處理的PMA有效抑制了qPCR對死菌DNA的擴(kuò)增,但對活菌的qPCR擴(kuò)增無影響。將該方法與平板計數(shù)法共同測定TSB純培養(yǎng)的布魯氏菌S2活菌數(shù),結(jié)果二者的測定值無統(tǒng)計學(xué)差異。隨后利用這兩種...

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

圖1 qPCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線

圖1 qPCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線

對PMA的最佳曝光時間、最適濃度進(jìn)行優(yōu)化。不同曝光時間結(jié)果顯示,隨著曝光時間的延長,Ct值不斷增大,當(dāng)曝光時間≥10min時各個曝光時間點(diǎn)的Ct值均無顯著差異(p>0.05)(圖2A);不同濃度PMA對熱致死菌作用的結(jié)果顯示,隨著PMA濃度的增大,擴(kuò)增的Ct值不斷增大,但當(dāng)濃度....


圖2 PMA處理?xiàng)l件的優(yōu)化結(jié)果

圖2 PMA處理?xiàng)l件的優(yōu)化結(jié)果

圖1qPCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線2.4特異性試驗(yàn)結(jié)果


圖3 PMA-qPCR的特異性試驗(yàn)結(jié)果

圖3 PMA-qPCR的特異性試驗(yàn)結(jié)果

以提取PMA處理過的大腸桿菌、沙門氏菌、小腸結(jié)腸炎耶氏菌、副溶血弧菌、S2菌株的基因組為模板,以質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為陽性對照,無RNase水為陰性對照,利用本研究建立的PMA-qPCR方法進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果顯示,除了S2菌株與質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品有特異性擴(kuò)增外,其余菌株及無RNase水均呈無擴(kuò)增(圖3....


圖4 PMA-qPCR的敏感性試驗(yàn)結(jié)果

圖4 PMA-qPCR的敏感性試驗(yàn)結(jié)果

提取PMA處理過的S2菌株基因組,10倍倍比稀釋后作為模板,采用PMA-qP-CR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,當(dāng)菌液濃度在2.0×103cfu/mL~2.0×108cfu/mL范圍內(nèi),布魯氏菌S2經(jīng)PMA處理(PMA-qPCR方法檢測)和未經(jīng)處理(常規(guī)qPCR檢測)的擴(kuò)增曲線基本吻合(圖3A....



本文編號:4042017

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