目的針對腎虛型阿爾茨海默病小鼠與對照組小鼠的對比轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,分析腎虛型阿爾茨海默病小鼠病理機(jī)制相關(guān)通路及基因差異表達(dá)情況,探討相關(guān)病理機(jī)制。方法設(shè)置正常組與腎虛阿爾茨海默病模型組,Illumina Hi Seq TM平臺(tái)檢測模型組小鼠基因轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異表達(dá),通過功能注釋以及富集分析模型組小鼠基因測序情況,篩選出與腎虛阿爾茨海默病病理機(jī)制相關(guān)的基因以及代謝途徑。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,采用Real-time PCR方法對參與病理機(jī)制形成的信號(hào)通路中差異表達(dá)基因進(jìn)行量化。結(jié)果通過GO、KEGG富集結(jié)果分析,腎虛阿爾茨海默病病理機(jī)制主要涉及ECM-receptor interaction、Protein digestion and absorption、Pancreatic secretion、Calcium signaling pathway、Cell adon molecules等信號(hào)途徑。腎虛型阿爾茨海默病模型組對比對照組差異基因一共1765個(gè),其中腎虛阿爾茨海默病組1219個(gè)基因表達(dá)上調(diào),546個(gè)基因表達(dá)下調(diào); Real-time PCR法對致病小鼠海馬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫關(guān)鍵基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄豐度驗(yàn)證...

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圖1差異基因柱狀圖

通過對照組與模型組各基因表達(dá)結(jié)果對比，獲得腎虛阿爾茨海默病小鼠海馬組織轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)情況。數(shù)據(jù)表明合計(jì)1765個(gè)基因表達(dá)存在差異，模型組樣本中1219個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，546個(gè)基因表達(dá)下調(diào)，差異表達(dá)，見圖1、圖2。圖2差異基因火山圖

圖2差異基因火山圖

圖1差異基因柱狀圖3.3差異表達(dá)基因富集分析

圖3差異基因GO分類注釋圖

與對照組相比，模型組有219個(gè)基因發(fā)生了上調(diào)與下調(diào)，共涉及219條KEGG信號(hào)通路，主要包括ECM-receptorinteraction(29個(gè)基因)、Proteindigestionandabsorption(25個(gè)基因)、Pancreaticsecretion(2....

圖4差異基因KEGG注釋統(tǒng)計(jì)圖

圖3差異基因GO分類注釋圖3.4腎虛阿爾茨海默病組關(guān)鍵基因轉(zhuǎn)錄活性驗(yàn)證

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