[目的]通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)分析成人退變性脊柱側(cè)凸（Adult degenerative scoliosis,ADS）患者外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA基因表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)的circRNA,對(duì)差異性表達(dá)的circRNA進(jìn)行生物學(xué)信息分析。構(gòu)建circRNA-miRNA相互調(diào)控作用網(wǎng)絡(luò)圖,尋找差異性表達(dá)的circRNA與miRNA結(jié)合位點(diǎn),探討差異性表達(dá)的circRNA在ADS患者中的生物學(xué)功能,并發(fā)現(xiàn)靈敏度及特異度高的潛在診斷標(biāo)志物,為深入認(rèn)識(shí)ADS在轉(zhuǎn)錄組學(xué)層面的發(fā)生發(fā)展機(jī)制及診治提供理論基礎(chǔ)。[方法]收集ADS患者、腰椎間盤(pán)突出癥患者（Lumbar disc herniation,LDH）、健康對(duì)照者外周血5ml,每組各3例。提取樣本總RNA,利用NanoDropND-1000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)總RNA的濃度及純度,變性瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA的完整性。根據(jù)總RNA質(zhì)檢結(jié)果,符合高通量測(cè)序技術(shù)要求后,利用第二代高通量Illumina HiSeq測(cè)序技術(shù)平臺(tái)檢測(cè)外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA的表達(dá)譜,篩選出差異性表達(dá)的circRNA。對(duì)差異表達(dá)的circRNA進(jìn)行火山圖分析、聚類(lèi)分...

【文章頁(yè)數(shù)】：83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ?yàn)椋裕颍幔睿?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，圖中對(duì)應(yīng)上樣序列為１－９原液上樣ｌｕｌ??圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表達(dá)譜分析??２．１統(tǒng)計(jì)原始序列數(shù)據(jù)??高通量測(cè)序得到的原始測(cè)序結(jié)果，其序列中可能含....

圖２ＡＤＳ＿１原始測(cè)序序列類(lèi)型??２７??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ?yàn)椋裕颍幔睿?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，圖中對(duì)應(yīng)上樣序列為１－９原液上樣ｌｕｌ??圖１所有樣本總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表達(dá)譜分析??２．１統(tǒng)計(jì)原始序列數(shù)據(jù)??高通量測(cè)序得到的原始測(cè)序結(jié)果，其序列中可能含....

圖４ＡＤＳ—３原始測(cè)序序列類(lèi)型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＡＤＳ＿２）??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４４２９５９２４，?９５．９３％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（７３１６２，?０．１６％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９１０１，?０．７６％）??Ａｄａｐｔｅｒ?Ｒｅｌａｔｅ....

圖６?ＬＤＨ＿２原始測(cè)序序列類(lèi)型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＬＤＨ＿ｌ）??，１?＿??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４６５９２５３７，?９５．８９％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（６２３１０１，?１．２８％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９３８３，?０．７２％）??Ａｄａｐｔｅｒ....

本文編號(hào)：4038575