發(fā)布時(shí)間：2025-03-18 06:12

　　 目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法研究金花葵抗心肌缺血的作用機(jī)制。方法:通過查找文獻(xiàn)挖掘金花葵中有效成分,利用數(shù)據(jù)庫(PubChem、Swiss Target Prediction)搜集整理化合物并根據(jù)口服生物利用度(OB)、類藥性(DL)值進(jìn)行篩選,用Gene Cards、Drug Bank篩選心肌缺血的靶點(diǎn),利用Venn diagram做出"化合物-靶點(diǎn)-疾病"間的韋恩圖,進(jìn)一步利用Cytoscape 3.2.1構(gòu)建"活性成分-靶點(diǎn)"之間的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖。構(gòu)建蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),進(jìn)行基因本體論(GO)功能、京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路的富集分析,進(jìn)行分子對接驗(yàn)證。結(jié)果:金花葵中化合物共72個,有效成分18個,共預(yù)測出83個金花葵抗心肌缺血的共同作用靶點(diǎn),GO功能富集分析顯示金花葵有效成分潛在作用靶點(diǎn)多分布于膜筏和膜微區(qū)中,KEGG富集通路共66條,其中神經(jīng)信號傳遞通路、糖尿病并發(fā)癥中晚期糖基化終末產(chǎn)物-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(AGE-RAGE)信號通路、Rap1信號通路、鈣信號通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路等通路對抗心肌缺血有明顯作用,分子對接中表明發(fā)揮抗心...

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【部分圖文】：

圖1 化合物有效成分靶點(diǎn)與疾病靶點(diǎn)交集

檢索現(xiàn)有有關(guān)金花葵成分的文獻(xiàn)[15～20]得到金花葵化合物共72個(表1)，在此基礎(chǔ)上根據(jù)OB(≥10%)、DL(≥0.1)值篩選出有良好生物活性的金花葵有效成分18個(表2)，包括柏木腦、槲皮素、楊梅素、葛根素等。經(jīng)TCMSP數(shù)據(jù)庫及PubChem數(shù)據(jù)庫共同檢索到與上述成分有關(guān)....

圖2 金花葵化合物與共同靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖

由圖3可知，構(gòu)建的蛋白相互作用的PPI網(wǎng)絡(luò)中包含81個節(jié)點(diǎn)及249條邊。該網(wǎng)絡(luò)平均度值為6.15，平均局部聚類系數(shù)為0.521，根據(jù)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)參數(shù)，共篩選出20個核心關(guān)鍵靶蛋白，其中白細(xì)胞介素6(IL-6)、血管內(nèi)皮生長因子A(VEGFA)、半胱氨酸天冬氨酸特異性蛋白酶(CASP....

圖3 STRING靶蛋白互作PPI網(wǎng)絡(luò)

圖2金花葵化合物與共同靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖圖4PPI網(wǎng)絡(luò)核心靶點(diǎn)

圖4 PPI網(wǎng)絡(luò)核心靶點(diǎn)

圖3STRING靶蛋白互作PPI網(wǎng)絡(luò)2.4GO和KEGG通路富集結(jié)果與分析

本文編號：4036129