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基于昇騰NPU的癌細(xì)胞檢測(cè)算法設(shè)計(jì)及實(shí)現(xiàn)

發(fā)布時(shí)間:2024-06-30 01:40
  為了解決臨床針圖像中循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)人工檢測(cè)效率低的問題,提出了利用經(jīng)典圖像處理方法進(jìn)行預(yù)處理并利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)進(jìn)行判斷識(shí)別的解決方法。通過預(yù)處理初步檢測(cè)出圖像中所有的疑似癌細(xì)胞,將得到的細(xì)胞圖像輸入到訓(xùn)練好的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行判斷并得到檢測(cè)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)中采用臨床采集的圖像進(jìn)行測(cè)試,測(cè)試過程中網(wǎng)絡(luò)判別準(zhǔn)確率為90%,且沒有出現(xiàn)漏判。結(jié)果表明:利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的癌細(xì)胞識(shí)別方法具有可靠的效果,相較于人工判斷具有精度上的優(yōu)勢(shì),能夠作為癌細(xì)胞識(shí)別的重要手段。同時(shí),算法在集成了NPU加速芯片的華為Atlas200 DK硬件平臺(tái)上運(yùn)行,實(shí)現(xiàn)了運(yùn)算加速,并為實(shí)現(xiàn)應(yīng)用的離線部署創(chuàng)造了條件。

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)

【部分圖文】:

圖1系統(tǒng)總體框圖

圖1系統(tǒng)總體框圖

通過搭建好的Atlas200DK硬件平臺(tái)可以展現(xiàn)NPU對(duì)于計(jì)算過程的加速作用,通過經(jīng)典圖像處理方法和本文方法的對(duì)比可以說明深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在癌細(xì)胞識(shí)別中的高精度。1系統(tǒng)總體框架


圖2采樣針使用方法示意及實(shí)物

圖2采樣針使用方法示意及實(shí)物

方案中圖像數(shù)據(jù)采集是通過埋在患者體內(nèi)的CellCollector循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)采樣針來實(shí)現(xiàn)的。其操作簡(jiǎn)單方便,選擇上肢肘部靜脈進(jìn)行穿刺,將CellCollector連接并固定在采樣針上,并停留在血液中30min。功能區(qū)表面的EpCAM抗體能夠特異性捕獲30min內(nèi)流經(jīng)....


圖3圖像樣例

圖3圖像樣例

從采樣針上獲取的圖像數(shù)據(jù)包括RGB三通道圖像以及一幅三色合成圖像,圖像的樣例可以參考圖3。樣例中展示的是單個(gè)細(xì)胞的圖像,其是經(jīng)過熒光染色方法處理并在顯微鏡下拍攝成像得到的,當(dāng)有同時(shí)滿足EpCAM/CKs+、Nuclear+、CD45-熒光表達(dá)(有綠色有藍(lán)色沒有紅色)并且具有腫瘤細(xì)....


圖4預(yù)處理流程

圖4預(yù)處理流程

圖像預(yù)處理環(huán)節(jié)采用經(jīng)典圖像方法進(jìn)行處理,具體流程如圖4所示。分別將圖像的RGB三通道圖灰度化并進(jìn)行灰度拉伸,對(duì)拉伸圖采用閾值分割的方法轉(zhuǎn)化為黑白圖像,由于采集過程中各種干擾因素的存在,需要對(duì)圖像用連通域分析計(jì)算面積并刪除面積較大的干擾區(qū)域。為了準(zhǔn)確定位目標(biāo)區(qū)域,需要通過預(yù)先設(shè)定好....



本文編號(hào):3998205

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