人類基因組中至少有78%的區(qū)域可以轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生RNA,其中只有很少一部分RNA可以編碼產(chǎn)生蛋白,其他的轉(zhuǎn)錄本都為非編碼RNA。包括Piwi互作RNA(piRNA)、核小RNA(snRNA)、小 RNA(microRNAs)、長鏈非編碼RNA(lncRNAs)等。之前一直認為這些非編碼RNA是轉(zhuǎn)錄過程中的副產(chǎn)物,然而最近越來越多的研究表明,這些非編碼RNA參與了生物體生命活動的各個方面。lncRNAs是一類序列長度超過200個堿基的非編碼RNA,目前的研究表明lncRNAs以多種方式調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄后修飾加工,翻譯等過程�；蜷g的長鏈非編碼RNA(lincRNAs)是lncRNAs的一種類型,它在基因組位置上不與其他基因重疊。目前已知的lincRNAs數(shù)量約占到lncRNAs的一半,在這些lincRNAs中只有不到1%的lincRNAs功能被揭示。而在這些有功能的lincRNAs中絕大多數(shù)的研究都是基于細胞水平上進行的,在個體水平上是否具有相同的功能還有待進一步的研究。并且在生物個體水平上,目前還沒有針對lincRNAs進行系統(tǒng)功能研究的工作。為了解決上述問題,我們使用優(yōu)化的CRISPR-...

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１長鏈非編碼ＲＮＡ的分類（Ｒａｏ，?２０１７）??注：根據(jù)ＩｎｃＲＮＡｓ與編碼蛋白的基因在基因組位置上的關(guān)系，將ＩｎｃＲＮＡｓ分為反義鏈??

ａｌ??ＩｎｃＲＮＡ），基因組位點上與編碼基因有重疊的長鏈非編碼ＲＮＡ（ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ?ｓｅｎｓｅ??ＩｎｃＲＮＡ），內(nèi)含子來源的長鏈非編碼ＲＮＡ?（ｉｎｔｒｏｎｉｃ?ＩｎｃＲＮＡ）和基因間的長鏈非??編碼?ＲＮＡ（ｌｉｎｃＲＮＡ）。??Ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ?ｓｅｎｓｅ....

圖３?ＣＲＩＳＰＲ－ｃａｓ９系統(tǒng)對基因的表達調(diào)控（Ｗａｎｇ?ｅｔ?ａｌ．，２０１６）??注：ＣＲＩＳＰＲｉ和ＣＲＩＳＰＲａ分別應(yīng)用在基因的轉(zhuǎn)錄抑制（ａ）和轉(zhuǎn)錄激活（ｂ）中

ｓｙ?ｖｋｍ??ｄＣａｓ９?ＳＡＭ?ｓｙｓｔｅｍ??ｒｍｎｒＴＴＴｎｔｒｎｒ?ＮｍＴｎＴ�。粒恚�?ｎ？ｎｎｉＴｒｒ？ｎｒ?ＴｔｒｏｎｎｍｎＫＴｒ?ｒｆｉｒｒｒｉｎ＾ｗｉｒ?Ｎ？ｍｎ？ｒｆｔｍＴＴｍｒ??Ｉ：ｉｉ：ｉｉ：ｎ：ｉｉ；ｉｉ－ｍ?：ｎｍ：ｉｉ；ｎ：ｉａ?ｉ；？：ｉ？ｉｉｕ....

圖５?ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９系統(tǒng)示意圖??注：對我們的ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ９系統(tǒng)進行適當?shù)膬?yōu)化，提高ＣＲ丨ＳＰＲ－Ｃａｓ９的切割效率??

－ＮｙＮＴｖＴ＾ｖＮ．ＮＮＮＮＮＮＳＮ＾Ｎ＾ＫＮ＾ＮＮＸ?ＮＮ７ＣＮＮＮ?－５＊??ｉ?：?■?；?；?—?Ｍ?：?１?；?；?ｉ?；＊：?？：：??ｔｊｄＷＡ?５ｉ－ＮＮＮＮＮＮＫＮＮＫＫＮＴＣＮＴＷＮ＇ＮＯＧＯｌＵｌ；ＡＡｔｉＡＯＣＵＡＵＧＣＴＸ＾?＇??ＵＡ．＼．＼ｔＵＵ?....

圖６?ｌｉｎｃＲＮＡ在不同染色體上的分布情況??接下來我們下載了?２６種線蟲ｌｉｎｃＲＮＡｓ對應(yīng)位點的注釋信息來分析ｌｉｎｃＲＮＡｓ??在２６種線蟲中序列的保守性（圖７ｃ）

釋的ｌｉｎｃＲＮＡｓ共有１７０個。為了系統(tǒng)的研究這些ｌｉｎｃＲＮＡｓ??的序列特征和表達特征，我們對秀麗線蟲不同發(fā)育階段和不同條件處理的九種狀??態(tài)下的蟲子進行了?ＲＮＡ深度測序（圖９ａ，１０）。這九種分別為胚胎、ＬＩ、Ｌ２、??ｄａｕｅｒ、Ｌ３、Ｌ４、早期成蟲、突變體（／？／ｗ....

本文編號：4043476