目的:1.通過回顧性分析新疆醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院收治的早期宮頸腺癌臨床病理資料,探討其與預后的關系,進一步確定宮頸腺癌的相關預后因素;2.篩選并初步探討宮頸腺癌的甲基化差異位點和基因,明確其在宮頸腺癌組織中的表達和分布情況;3.分析目標SOX1、CCND1、PRKCA基因甲基化在早期宮頸腺癌組織中的表達差異性,尋找預測宮頸腺癌發(fā)生的分子標記物。方法:1.收集和整理2010年1月至2017年12月8年間新疆醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院收治進行了宮頸癌根治性手術的早期宮頸腺癌(ⅠB1-ⅡA2期)患者資料,對其中有可能影響宮頸腺癌預后的指標進行單因素和多因素的研究;2.采用Illumina850K甲基化芯片技術對5例宮頸腺癌組織及5例正常宮頸組織進行甲基化情況分析,篩選出DNA異常甲基化基因,通過基因本體(GO)功能注釋、富集分析和KEGG信號轉導通路富集分析,初步對宮頸腺癌甲基化情況進行分析;3.采用亞硫酸鹽測序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)及實時定量RT-PCR(Quantitative RealTime RT-PCR,Q-RT-PCR)方法對宮頸腺癌組織、宮頸鱗狀...

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圖1-1早期宮頸腺癌5年無瘤生存率曲線

2.3宮頸腺癌復發(fā)及死亡危險因素分析本組患者中，復發(fā)17例，死亡12例，5年無瘤生存率81.20%，5年總生存率86.70%，早期宮頸腺癌5年無瘤生存曲線及5年總生存曲線見圖1-1，圖1-2。圖1-1早期宮頸腺癌5年無瘤生存率曲線Figure1-1Fiveyearsu....

圖2-1總DNA瓊脂糖凝膠電泳圖

樣本存在部分降解，完整性有所缺失；倘若于其他位置存在雜帶，表示包含有別的雜質（點樣孔位置有條帶可能為蛋白質或多糖，更遠位置有條帶可能為RNA）。見圖2-1。圖2-1總DNA瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.2-1TotalDNAagarosegelelectrophores....

圖2-2原始beta值的密度圖

濾的探針比例，如果某個樣本中濾掉的探針比例超過5%，就要考慮在后續(xù)的分析中去掉這個樣本。默認我們使用BMIQ的方法進行beta值的標準化處理（Teschendorff，2013），詳見圖2-2，可見圖中未見有異常的樣本。標準化之后beta值的主成分分析（PCA分析），利用降維度的....

圖2-3標準化之后beta值的PCA分析

新疆醫(yī)科大學博士學位論文44圖2-3標準化之后beta值的PCA分析Fig2-3PCAanalysisofbetavalueafterstandardization2.3甲基化相關分析2.3.1MVP（MethylationVariablePositi....

本文編號：4056260