罕見病發(fā)病率低,但患者基數大且難以診療,嚴重危害患者身體健康的同時對患者家庭和社會造成嚴重的經濟負擔。隨著第二代測序技術的成熟,基因檢測技術已廣泛應用于罕見遺傳病的檢測。然而傳統(tǒng)的臨床基因檢測報告流程存在著局限性,一方面遺傳疾病學知識來源分散,無法快速準確的獲取遺傳疾病學知識;一方面現階段測序數據存儲方式無法實現大規(guī)模患者數量下跨患者變異信息的高效檢索、篩選和統(tǒng)計利用;另一方面罕見遺傳病難以診斷,缺乏候選疾病推薦服務以輔助遺傳病診斷決策;另外工作流程還缺乏系統(tǒng)的信息化管理。這些不足嚴重影響著傳統(tǒng)臨床基因檢測報告的性能,使其已不能滿足現階段的臨床需求。因此亟待針對其中關鍵問題開展針對性應用研究,并建立服務于臨床的基因檢測報告系統(tǒng)來輔助臨床基因檢測報告工作。本論文的具體研究工作包括:(1)服務于臨床基因檢測報告的精準醫(yī)學知識庫構建。以權威遺傳病變異數據解讀指南為基礎,結合臨床基因檢測報告實踐需求,對常用的12種遺傳疾病學數據庫進行整合收錄,在將原始數據進行標準化和結構化存儲的基礎上,根據多種臨床場景的需求設計15張數據庫表間關系和使用規(guī)則,并利用原始知識生成遺傳疾病學知識網絡,構建了精準醫(yī)學...

【文章頁數】：86 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１傳統(tǒng)測序方式和ＮＧＳ測序方式發(fā)現致病基因數量統(tǒng)計??１．１．３傳統(tǒng)臨床基因檢測報告流程??臨床醫(yī)師通過分析患者ＮＧＳ測序的大量基因變異數據，并結合權威遺傳疾??

保持了高準確性的前提下能大幅度降低測序??的成本和測序時長（由幾年縮短為一周），特別是全外顯子組測序（ｗｈｏｌｅ－ｅｘｏｍｅ??ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，?ＷＥＳ）和目標區(qū)域測序技術，可僅僅對約２２０００個外顯子或針對特??定臨床表型相關的數百基因進行測序［１４］，已經廣泛用于臨床新....

圖１．２傳統(tǒng)臨床基因檢測報告流程??

浙江大學碩士學位論文?＾??１１?＇?■??＇￣￣￣．■一—１??這庫??ＺＺＬ??宦網檢索??ｖ雜??獲取?＿患者表型１０?????篆釀史??圖１．２傳統(tǒng)臨床基因檢測報告流程??然而，傳統(tǒng)的臨床基因檢測報告流程在實踐過程中存在一些問題，嚴重影響??了臨床基因檢測報告工作的效率和....

圖２．１精準醫(yī)學知識庫數據表設計圖??２．３數據庫構建結果??精準醫(yī)學知識庫整合了臨床基因檢測報告流程中常用的罕見遺傳病疾病知??識庫、表型知識庫、基因和突變知識庫、參考文獻數據庫等多類遺傳疾病學知識??

ｎ?ｄｂｓｎｐ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｄｂｖａｒ??ｊ?Ｉ?Ｂ因本體?１?Ｉ?ｄｂｓｎｐ突変?Ｉ?ｄｂｖａｒ突變?：??ｇｅｎｅ?ｎｃｂｉ??Ｌ－一???ｉ?￣｜人類參考基因?：??ｅｎｓｅｍｂｌ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｃｉｉｎｖａｒ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｈｇｍｄ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ....

圖２．２ＨＰＯ（ＣＨＰＯ）本體層次結構（鼻竇炎部分）??本文共整合與遺傳疾病相關的標準表型共５７３６條，通過公式（２．１）計算任??意表型節(jié)點之間的最短距離構建標準表型相似性網絡，并通過多維標度分析??

浙江大學碩士學位論文?服務于臨床基因檢測報告的精準醫(yī)學知識庫構建??“慢性鼻竇炎”節(jié)點到“鼻竇炎”節(jié)點之間最短距離為】，“急性鼻竇炎”節(jié)點??到“鼻竇炎”節(jié)點最短距離也為１，則節(jié)點“慢性鼻竇炎”和“急性鼻竇炎”之??間的距離為２。ｄｗａｘ表示在整合的ＨＰＯ標準表型數據庫中任意表型....

本文編號：4049728