蠟梅作為常用的園林植物和木本切花,由于其獨(dú)特的開花時(shí)間和濃郁的花香,具有較高的觀賞價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值,其觀賞價(jià)值主要取決于花朵的開放情況,為了探索乙烯是否影響蠟梅的花朵開放,本文使用乙烯和1-MCP處理蠟梅花朵,利用RNA-seq技術(shù),探索乙烯對(duì)蠟梅花朵的影響及克隆乙烯響應(yīng)因子基因,為調(diào)控蠟梅花朵開放,改善切花品質(zhì)提供幫助。本研究的主要結(jié)果如下:1.在本研究中,提取蠟梅蕾期花朵總RNA,利用高通量Illumina HiSeq4000平臺(tái)測序,共得到0h樣本40264927條clean data、4h樣本41064633條clean reads、4hEth樣本39230880條clean reads、24h樣本41158515條clean reads和24h1-mcp樣本40851828條clean reads。用Trinity軟件對(duì)所有的clean reads進(jìn)行拼接,共得到了195349個(gè)轉(zhuǎn)錄本序列,平均長度為919bp。2.將拼接得到的Unigene序列與NR、SwissProt、COG、GO和KEGG等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),其中,共有52352（26.8%）條轉(zhuǎn)錄本序列在NCBI非冗余獲得了...

【文章頁數(shù)】：86 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1乙烯的生物合成途徑[35]

西南大學(xué)碩士學(xué)位論文及葉片脫落、衰老等很多階段都起著極其重要的調(diào)控作用[33-34]前體是蛋氨酸（Methionine），直接前體是1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸（公認(rèn)的乙烯合成過程是通過YangCycle，蛋氨酸在蛋氨酸腺腺S-腺苷蛋氨酸，它是許多細(xì)胞的甲基供體，并在1-氨....

圖1-2RNA-Seq的典型流程

西南大學(xué)碩士學(xué)位論文于傳統(tǒng)的Sanger測序而言，基于高通量的RNA測序技術(shù)（RNA-Seq）經(jīng)濟(jì)且通量高，而且不需依附基因組信息即可進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組研究，大大加快了非模物的研究。RNA-Seq己經(jīng)成為應(yīng)用最為廣泛的轉(zhuǎn)錄組研究方法。RNA-Se下諸多優(yōu)勢：（1）通量高；（2）....

圖3-1真核轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)流程

圖3-1真核轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)流程切及統(tǒng)計(jì)的原始圖像數(shù)據(jù)經(jīng)過BaseCalling轉(zhuǎn)原始測序數(shù)據(jù)（RawData）文件。FQ堿基序列以及測序質(zhì)量等基本信息。堿基質(zhì)量字符，每個(gè)堿基質(zhì)量字符對(duì)應(yīng)系），即為該堿基的測序質(zhì)量得分(Ph代表不同的堿基測序錯(cuò)誤率，如當(dāng)Q為1%和....

圖3-2Trinity算法原理示意圖

步Inchworm將原始序列建立起一個(gè)k-mergraph（K=25），通法尋找graph中的所有路徑，inchworm每搜索到一條路徑就“contig”，最后得到了一組“contig”；步Chrysalis，將第一步得到的“contig”進(jìn)行分組，這時(shí)如果所得中....

本文編號(hào)：4054182