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應(yīng)用PageRank算法于動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物理論來探測臨界點

發(fā)布時間:2025-03-15 05:30
  通過分析測量數(shù)據(jù)來預(yù)測復(fù)雜系統(tǒng)的臨界現(xiàn)象是生產(chǎn)生活中亟待解決的問題,為此人們開發(fā)出了臨界點理論;為了適應(yīng)生物信息領(lǐng)域中以基因芯片為代表的高通量表達譜技術(shù)所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),在臨界點理論的基礎(chǔ)之上又發(fā)展出了動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物理論。它依據(jù)測量數(shù)據(jù)在每一個測量時間點上分別建立模型網(wǎng)絡(luò);通過尋找在臨界點處展現(xiàn)出一定統(tǒng)計特征的子網(wǎng)絡(luò),即動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物子網(wǎng)絡(luò),來預(yù)測臨界現(xiàn)象。動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物理論在預(yù)測病情的發(fā)展,探索疾病機制等等方面中有很大應(yīng)用價值。高通量表達數(shù)據(jù)中的龐大信息量,啟發(fā)我們從信息提取的角度來看待與之相關(guān)的問題;而以Page Rank算法為基礎(chǔ)的搜索引擎,是信息提取問題最成功的解決方案之一。故而在此研究中,我們以互聯(lián)網(wǎng)領(lǐng)域中的Page Rank算法為核心,基于生物信息領(lǐng)域中的動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物理論,設(shè)計了一個臨界點探測算法。為了驗證我們的算法,我們采用了隨機生成的具有臨界意義的高維模擬數(shù)據(jù)集合進行檢驗;這相比于文獻中維數(shù)不超過20的模擬數(shù)據(jù)集合更加有說服力。另外我們也將該算法應(yīng)用于相關(guān)文獻中分析過的數(shù)據(jù)集合之上,并得到了與文獻相一致的結(jié)果到目前為止,文獻中基于動態(tài)網(wǎng)絡(luò)標志物理論的算法仍存在一項不足:盡管...

【文章頁數(shù)】:41 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1.(a),臨界現(xiàn)象中三個狀態(tài)的劃分

圖1-1.(a),臨界現(xiàn)象中三個狀態(tài)的劃分

華南理工大學碩士學位論文2圖1-1.(a),臨界現(xiàn)象中三個狀態(tài)的劃分。(b),臨界點附近回復(fù)能力與穩(wěn)定性呈正相關(guān)。由于臨界信號是基于擾動的,故而需要在系統(tǒng)運動方程中引入擾動項(),得到含擾動項的系統(tǒng)運動方程=(;)+()。又由于我們只需討論平衡點附近的局域性質(zhì),我們?nèi)∩鲜皆?()....


圖1-2.(a),復(fù)雜系統(tǒng)臨界點理論中常見的平衡曲線折疊模型在物質(zhì)系統(tǒng)臨界點理論中不反映臨界現(xiàn)象

圖1-2.(a),復(fù)雜系統(tǒng)臨界點理論中常見的平衡曲線折疊模型在物質(zhì)系統(tǒng)臨界點理論中不反映臨界現(xiàn)象

華南理工大學碩士學位論文4得以在不同平衡點間取得穩(wěn)定分布。這樣,復(fù)雜系統(tǒng)臨界點理論通常認為系統(tǒng)接近臨界點時回復(fù)能力趨0伴隨穩(wěn)定性趨0;而物質(zhì)系統(tǒng)的臨界點理論要求系統(tǒng)接近臨界點時平衡點仍是全局唯一的,即回復(fù)能力保持無窮大而穩(wěn)定性趨0。具體而言,復(fù)雜系統(tǒng)臨界點理論中舉例講解臨界現(xiàn)象時....


圖2-1.在稠密網(wǎng)絡(luò)中,邊的強度越均勻,PageRank值分布也越均勻

圖2-1.在稠密網(wǎng)絡(luò)中,邊的強度越均勻,PageRank值分布也越均勻

?傭?溝肈NB節(jié)點平均來說具有較高的PageRank值。DNB子網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部連接緊密,在臨界點上節(jié)點間邊的強度理論上趨于1;在均勻全連接網(wǎng)絡(luò)的極限情況中,各個節(jié)點的PageRank值相等;由此我們認為臨界點附近PageRank值在DNB子網(wǎng)絡(luò)內(nèi)分布較為均勻(圖2-1)。這樣,我們對模....


圖2-2.比較DNB之外高PageRank值的節(jié)點以及DNB中的節(jié)點,以之為中心的局部網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯著不同

圖2-2.比較DNB之外高PageRank值的節(jié)點以及DNB中的節(jié)點,以之為中心的局部網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯著不同

第二章算法設(shè)計15點還是DNB節(jié)點,也具有較高的PageRank值;而DNB之外高PageRank值節(jié)點的相鄰節(jié)點是非DNB節(jié)點,通常PageRank值較低(圖2-2)。局部來看,DNB節(jié)點的PageRank值較高是因為相鄰節(jié)點PageRank值也較高;而DNB之外節(jié)點的高Pag....



本文編號:4035237

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