稻瘟病是水稻的三大病害之一,其嚴(yán)重影響了水稻的產(chǎn)量。目前主要通過圖位克隆,分子標(biāo)記等方法鑒定新的抗稻瘟病基因。本研究通過全基因組關(guān)聯(lián)分析深度發(fā)掘自然群體中的抗稻瘟病新基因。為今后培育持久抗稻瘟病品種提供理論和實(shí)踐意義。本研究利用5個(gè)稻瘟病生理小種對(duì)來自國際水稻所的584份多樣性水稻種質(zhì)資源進(jìn)行接種鑒定,結(jié)合700K的高密度的SNP(單核苷酸多態(tài)性)圖譜,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘新的抗稻瘟病基因,篩選高抗品種。生理小種來自云南稻瘟病菌多樣性中心其中包括YN485、YN661、YN716和來自浙江的稻瘟病生理小種RB22和來自韓國的稻瘟病生理小種RO1-1。所有的生理小種都是強(qiáng)致病性菌株。研究結(jié)果如下:1、對(duì)584份水稻國際種質(zhì)資源進(jìn)行接種鑒定,獲得55份高抗稻瘟病品種,根據(jù)國際鑒定標(biāo)準(zhǔn)其對(duì)5個(gè)生理小種的抗性小于等于2級(jí)。2、溫帶粳稻亞群的平均感病率為77.08%,混合群體的平均感病率為52.82%,AUS亞群的平均感病率為49.5%,芳香亞群的平均感病率為47.8%,秈稻亞群的平均感病率為34.33%,熱帶粳稻亞群的平均感病率為27.38%。其中熱帶粳稻亞群的整體抗性遠(yuǎn)大于溫帶粳稻亞群的整...

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.群體中5個(gè)生理小種的抗性分布

10圖1.群體中5個(gè)生理小種的抗性分布Figure1.Thedistributionof5isolatesforpopulationresistance由表1可知，來自云南稻瘟病生理小種YN485是從秈稻上分離而來的小種，其病性強(qiáng)，整體發(fā)病比較嚴(yán)重....

圖2.群體親緣關(guān)系圖

3.3結(jié)果與分析3.3.1關(guān)聯(lián)分析獲得新的位點(diǎn)本研究中，利用高密度的SNP數(shù)據(jù)結(jié)合接種鑒定的結(jié)果。使用Tassel3.0結(jié)合700K的高密度單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)對(duì)其進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。親緣關(guān)系圖2可知在水稻多樣性群體2中Indi（Indica）秈稻亞群占這個(gè)群體的....

圖3.5個(gè)生理小種的曼哈頓散點(diǎn)圖

18圖3.5個(gè)生理小種的曼哈頓散點(diǎn)圖Figure3．TheManhattanplotsof5isolates3.3.2候選基因分類根據(jù)基因注釋的信息我們將獲得候選基因進(jìn)行分類。174個(gè)候選抗性基因分成9大類（圖4）。其中編碼轉(zhuǎn)錄因子、鋅指酶等（Tra....

圖4.候選基因的分類Figure4．Classificationofthecandidategenes

圖4.候選基因的分類Figure4．Classificationofthecandidategenes3.4討論本章中，我們利用獲得的表型數(shù)據(jù)結(jié)合高密度的SNP數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，獲得了與稻瘟病抗性相關(guān)的顯著性標(biāo)記。結(jié)合曼哈頓散點(diǎn)圖篩選出P值較高的標(biāo)記....

本文編號(hào)：4057096