AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子在植物中廣泛存在,其在植物生長發(fā)育及逆境應(yīng)答過程中均發(fā)揮重要作用。但目前對花椰菜中AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子及其功能知之甚少。本研究利用前期花椰菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用RT-PCR等方法從花椰菜中分離并克隆得到一個AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子:ERF056�；蛐蛄屑胺肿犹卣鞣治鼋Y(jié)果表明,花椰菜ERF056全長741 bp,編碼246個氨基酸,具有一個AP2/ERF結(jié)構(gòu)域,其編碼產(chǎn)物為疏水性蛋白,無跨膜結(jié)構(gòu),內(nèi)部以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。聚類分析結(jié)果顯示,花椰菜ERF056與油菜和甘藍中相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子具有較高相似性。轉(zhuǎn)錄表達譜分析結(jié)果顯示,ERF056在花椰菜不同組織中均有表達,其中花球中表達量最高。鹽脅迫表達特征分析表明,花椰菜ERF056在鹽脅迫條件下呈下調(diào)表達,暗示其負向響應(yīng)鹽脅迫。相關(guān)研究為深入揭示花椰菜ERF056在鹽脅迫應(yīng)答中的功能及調(diào)控機制提供了幫助。

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【部分圖文】：

圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴增

在NCBI的CDD數(shù)據(jù)庫中對ERF056轉(zhuǎn)錄因子進行保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測，ERF056轉(zhuǎn)錄因子具有一個AP2/ERF保守結(jié)構(gòu)域，該結(jié)果進一步證實花椰菜ERF056屬于ERF亞家族(圖2A)。使用在線分析軟件ProtParam，對花椰菜ERF056進行一級結(jié)構(gòu)預(yù)測，結(jié)果顯示，花椰菜ERF....

圖2花椰菜ERF056氨基酸序列分子特征分析

圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴增1.3花椰菜ERF056轉(zhuǎn)錄因子系統(tǒng)進化分析

圖4不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子motifs分析

目前已有多篇關(guān)于ERF在鹽脅迫下的表達模式分析研究。研究表明：油菜BnaERF-B3-hyl5受鹽、干旱、低溫誘導(dǎo)表達，轉(zhuǎn)BnaERF-B3-hyl5擬南芥抗冷凍能力提高(姜海華等,2010)；花生AhERF6在低溫、干旱、高鹽脅迫下均受到明顯誘導(dǎo)，過表達AhERF6提高耐低溫和....

圖5不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子系統(tǒng)進化分析

圖4不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子motifs分析3材料與方法

本文編號：4005272