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新疆維吾爾族人群白介素23受體基因單核苷酸多態(tài)性和拷貝數(shù)變異與肺結核易感性的相關性研究

發(fā)布時間:2020-10-28 09:53
   目的:探討白細胞介素(IL)-23受體基因單核苷酸多態(tài)性和拷貝數(shù)變異與新疆維吾爾族人群肺結核和耐藥肺結核易感性的相關性。方法:采用配對病例對照的研究方法,以2013年10月至2014年4月新疆喀什地區(qū)肺科醫(yī)院收治的250例新疆維吾爾族痰結核分枝桿菌培養(yǎng)陽性的肺結核患者(病例組)和同期250名健康體檢者(對照組)為研究對象,采用SNaPshot技術檢測IL-23受體基因全部外顯子及部分鄰近內含子區(qū)的13個單核苷酸多態(tài)性位點的基因型,同時采用Taqman實時PCR檢測IL-23受體基因第11外顯子區(qū)的基因拷貝數(shù),分析其基因型、等位基因、單體型和拷貝數(shù)變異與肺結核和耐藥肺結核易感性的關系。結果:IL-23受體基因的rs10889677和rs7518660與新疆維吾爾族人群肺結核的易感性相關(OR=1.53,95%CI 1.01-2.31;OR=6.25,95%CI 3.85-10.00),rs11465802與耐藥肺結核的發(fā)生相關(OR=2.90,95%CI 1.69~4.98);其第11外顯子區(qū)的拷貝數(shù)增加與肺結核易感性相關(χ2=10.475,P=0.0012,OR=2.611,95%CI:1.437~4.744);且在對照組中基于單倍體水平IL-23R的CNV與rs10889677和rs7518660之間的LD關系進行分析,研究結果顯示,其r2均0.01,表明CNV與這兩個SNPs之間僅存在非常弱的LD。結論:IL-23受體基因的rs10889677和rs7518660可能是新疆維吾爾族人群肺結核發(fā)生的危險因素,rs11465802可能是耐藥肺結核發(fā)生的危險因素;IL-23受體基因第11外顯子的拷貝數(shù)增加可能是肺結核發(fā)生的獨立的危險因素。本研究結果為活動性肺結核高危人群的識別提供了參考資料,對研究IL-23受體基因拷貝數(shù)變異在復雜疾病和IL-23受體基因相關性疾病中的作用具有重要的指導價值。
【學位單位】:新疆醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2015
【中圖分類】:R521
【部分圖文】:

柱狀圖,病例,柱狀圖,對照組


采用內參RnaseP的Ct值標化IL23R基因的Ct值,W計算每個標本的Act值煙??6)。病例組與對照組之間的Act值具有顯著性差異(尸=0.0002),表明兩組之間正-23民??基因的拷貝數(shù)(中位數(shù))具有顯著性差異(圖7)。兩組么間的比-23民的各種拷貝數(shù)??(1-4拷貝)分布頻率比較也顯示兩姐之間的拷貝數(shù)分布具有顯著性差異(戶=0.001,??圖7;於0.01,表8)。研究結果濕示,病例姐中心23民基因的拷貝數(shù)變異(CNV)的??分布頻率明顯高于對照組<0.0001,表9)。進一步分析顯示,病例組中正-23民基??因的拷巧數(shù)增加的分布頻率明顯高于對照組(AC泛-1,P=0.0012,表10)。??研究結果表明,位于比-23民基因外顯子11的拷貝數(shù)變異(CNV)是肺結核發(fā)生的??危險因素(戶<0.0001,餅??95%C/2.875(1.655-4.994)隸9),具有該位點CNV的個體??發(fā)生肺結核的風險是拷貝正常的個體的2.的5倍。進一步分析顯示,位于正-23民基??因外最子11的拷巧數(shù)増加是肺結核發(fā)生的危險因素(f=〇.〇〇12.??2.611(1.437-4.744)

柱狀圖,病例,柱狀圖,對照組


采用內參RnaseP的Ct值標化IL23R基因的Ct值,W計算每個標本的Act值煙??6)。病例組與對照組之間的Act值具有顯著性差異(尸=0.0002),表明兩組之間正-23民??基因的拷貝數(shù)(中位數(shù))具有顯著性差異(圖7)。兩組么間的比-23民的各種拷貝數(shù)??(1-4拷貝)分布頻率比較也顯示兩姐之間的拷貝數(shù)分布具有顯著性差異(戶=0.001,??圖7;於0.01,表8)。研究結果濕示,病例姐中心23民基因的拷貝數(shù)變異(CNV)的??分布頻率明顯高于對照組<0.0001,表9)。進一步分析顯示,病例組中正-23民基??因的拷巧數(shù)增加的分布頻率明顯高于對照組(AC泛-1,P=0.0012,表10)。??研究結果表明,位于比-23民基因外顯子11的拷貝數(shù)變異(CNV)是肺結核發(fā)生的??危險因素(戶<0.0001,餅??95%C/2.875(1.655-4.994)隸9),具有該位點CNV的個體??發(fā)生肺結核的風險是拷貝正常的個體的2.的5倍。進一步分析顯示,位于正-23民基??因外最子11的拷巧數(shù)増加是肺結核發(fā)生的危險因素(f=〇.〇〇12.??2.611(1.437-4.744)
【參考文獻】

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1 金婧;孫琳;焦偉偉;趙順英;李惠民;關曉蕾;焦安夏;遲巍;江載芳;申阿東;;NRAMP1基因多態(tài)性與中國漢族兒童結核病易感性研究[J];中國當代兒科雜志;2009年04期

2 張杰;鄧喜玲;王霞;周江;李宇;吳芳;張萬江;;MBL基因多態(tài)性與新疆哈薩克族結核病易感性的相關性研究[J];農墾醫(yī)學;2011年02期

3 熊宇;周丹;陶楊;李革;;Sp110基因與肺結核易感相關性研究[J];重慶醫(yī)科大學學報;2008年04期



本文編號:2859931

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