【背景】淋病是指人體感染淋病奈瑟菌后出現(xiàn)的泌尿生殖道的化膿性炎癥,當前淋病的發(fā)病率依舊猖獗,WHO報導每年新發(fā)淋病病例約有1.06億~([1]),淋病主要感染人群為青壯年,不僅嚴重影響患者生活質(zhì)量和身心健康,還給整個社會帶來巨大健康、醫(yī)療和經(jīng)濟負擔~([2]),已成為越來越嚴峻的重要公共衛(wèi)生問題,耐藥淋球菌的不斷出現(xiàn)及傳播控制的困難,致使上述問題變得日益嚴峻。淋球菌具有非凡的耐藥進化能力,已相繼淘汰了一系列曾經(jīng)作為淋病一線治療的抗菌藥物,目前頭孢曲松在大多數(shù)國家或地區(qū)單用或是與阿奇霉素聯(lián)合作為一線治療的藥物,同樣受到耐藥威脅。自2011年日本報道了首例由廣譜耐藥(Extensively drug~resistant,XDR)淋球菌H041株導致的頭孢曲松臨床治療失敗的病例~([3]),許多國家或地區(qū)也相繼報導頭孢曲松臨床治療失敗病例,本課題組在2000年至2016年間監(jiān)測發(fā)現(xiàn)淋球菌頭孢曲松敏感性顯著下降。應用已知的參考基因組對個體或群體進行測序的基因組分析方法,稱為全基因組測序,用于分析個體或群體水平的遺傳變異。目前關(guān)于頭孢曲松耐藥主要關(guān)注penA基因,此外還有penB、mtrR、ponA、pilQ、gyrA、parC等,但單獨penA、23S rRNA、mtrR、porB或聯(lián)合penA/23S rRNA/mtrR均難以解釋淋球菌頭孢曲松耐藥現(xiàn)象的發(fā)生。全基因組測序有望發(fā)現(xiàn)淋球菌對頭孢曲松耐藥已知或未知的耐藥位點。【目的】本研究對2017年廣州地區(qū)淋球菌7種抗生素耐藥性進行監(jiān)測,與前期結(jié)果對比分析其趨勢,同時收集1999年01月至2017年12月廣州醫(yī)科大學皮膚病研究所性病�？崎T診凍存的約1700株淋球菌大樣本,篩選出實驗菌株進行全基因測序以發(fā)現(xiàn)相關(guān)候選已知/未知基因,以進一步證實其與淋球菌頭孢曲松耐藥的相關(guān)性�！痉椒ā渴占�2017年廣州地區(qū)臨床分離培養(yǎng)的101株淋球菌,用瓊脂稀釋法測定7種抗生素的最小抑菌濃度(MIC),根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的標準判定其敏感性。收集1999年01月至2017年12月廣州地區(qū)約1700株淋球菌大樣本進行復蘇、分離、鑒定,篩選出其他抗生素MIC值相似的頭孢曲松低敏株與敏感株進行全基因測序,提取總DNA,組裝、功能注釋、比較基因組分析以及通過Genbank分析突變位點、基因及其產(chǎn)物�！窘Y(jié)果】1.2017年廣州地區(qū)檢出產(chǎn)青霉素酶淋球菌(PPNG)達21.42%(21/98),質(zhì)粒介導的高度耐四環(huán)素淋球菌TRNG達24.49%(24/98),環(huán)丙沙星耐藥率高達100%(98/98),阿奇霉素耐藥率達6.12%(6/98),大觀霉素未發(fā)現(xiàn)耐藥菌,頭孢曲松低敏率達6.93%(7/101)。2.全基因組測序得出頭孢曲松低敏株與頭孢曲松敏感株在9個基因突變位點上有統(tǒng)計學差異:NC_011035_2141888、NC_011035_54696、NC_011035_1852095、NC_011035_54846、NC_011035_1756014、NC_011035_2148154、NC_011035_2148180、NC_011035_1385558、NC_011035_2182987,其基因產(chǎn)物為轉(zhuǎn)座酶、PilC2、氫化酶表達蛋白、α/β水解酶、腸菌素受體FetA、周質(zhì)轉(zhuǎn)運體�！窘Y(jié)論】1.2017年廣州地區(qū)淋球菌對7種抗生素的最小抑菌濃度(MIC)檢測顯示,PPNG與TRNG的檢出率依然較高;環(huán)丙沙星無敏感株,大觀霉素無耐藥株,頭孢曲松敏感性下降;2.全基因測序得出頭孢曲松低敏株與頭孢曲松敏感株在9個基因突變位點上有統(tǒng)計學差異,其基因產(chǎn)物轉(zhuǎn)座酶、PilC2、氫化酶表達蛋白、α/β水解酶、腸菌素受體FetA、周質(zhì)轉(zhuǎn)運體,可能與淋球菌頭孢曲松耐藥機制相關(guān)。
【學位單位】：廣州醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：R759.2
【部分圖文】：

圖 3-1：第一列為生化過程；第二列為細胞學組成成分；第三列為分子層面功能。（2）KEGG數(shù)據(jù)庫通過劃分歸類生物通路，得出八大類。根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果來看，研究中淋球菌與人類疾病耐藥性相關(guān)的基因有51個。（KEGG數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果如圖：圖3-2）圖3-2 KEGG數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果
【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 陳霄霄;張芳;趙恬;楊娟;張錫寶;;淋球菌耐藥性的研究進展[J];中國中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學雜志;2015年01期

2 龔子鑒;賴維;;正確認識和應對耐頭孢曲松淋球菌[J];臨床皮膚科雜志;2014年09期

3 蔣法興;其木格;錢革;鄭波;葉順章;蘇曉紅;胡白;王千秋;;頭孢曲松低敏的淋球菌中青霉素結(jié)合蛋白2氨基酸替代或插入模式研究[J];中華皮膚科雜志;2008年07期

本文編號：2860133