丹參（Salvia miltiorrhiza Bge.）柯巴基焦磷酸合酶1（SmCPS1）基因是編碼丹參酮類成分生物合成途徑下游部分的第一個關鍵酶基因,其表達調控對丹參酮類成分含量的積累至關重要。有關其表達機制的研究對丹參良種選育和丹參酮類成分的生物合成研究具有重要意義。作為決定基因時空特異性表達的主要因素之一,啟動子上的序列變化和甲基化修飾均可能改變基因的表達模式。因此,本研究試從（1）不同遺傳背景丹參SmCPS1基因啟動子序列多態(tài)性（2）丹參根、莖和葉中SmCPS1基因啟動子序列甲基化特征這兩個角度探究SmCPS1基因表達調控機制。主要結果如下:（1）丹參SmCPS1基因啟動子區(qū)序列含有較編碼區(qū)更豐富的多態(tài)性且有些多態(tài)性位點處于轉錄因子結合位點的關鍵位點,如:MIKC_MADS、C2H2、ARR-B、CPP、MYB、AP2、MIKC-MAC、TCP、Dof和TATA-box;這些位點對應的轉錄因子涉及植物器官如花、種子的形成,參與碳代謝途徑中的基因光調控過程,響應赤霉素、生長素以及鹽、冷和旱脅迫等過程。（2）不同遺傳背景丹參中SmCPS1基因表達量不同,且Mant...

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【學位級別】：碩士

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圖1.SmCPS1不同區(qū)域的序列多樣性

SmCPS1序列多態(tài)性分布圖如圖2所示。圖2SmCPS1序列多態(tài)性分布圖。

圖2 SmCPS1序列多態(tài)性分布圖。

圖1.SmCPS1不同區(qū)域的序列多樣性2.2.3丹參SmCPS1啟動子區(qū)元件預測結果

圖3.位于SmCPS1啟動子區(qū)的轉錄因子結合位點所對應的轉錄因子家族數(shù)量統(tǒng)計

在所測啟動子區(qū)范圍內,共預測出由81個轉錄因子和117個轉錄因子結合位點組成的33個調控區(qū)（表4）。合并同具有重疊區(qū)域的同家族轉錄因子后發(fā)現(xiàn),SmCPS1啟動子區(qū)分布了23個不同的轉錄因子家族（圖3）。MIKC_MADS和Dof家族的轉錄因子分布數(shù)量最多（各8....

圖4.基于SmCPS1序列多態(tài)性位點,Neighbor-Joining法聚類結果

功能性多態(tài)性位點如表6所示。位于啟動子上功能性多態(tài)性區(qū)域的有12個。其中插入/缺失型突變3個。串聯(lián)重復型突變4個,其余為單堿基突變型變異。位于外顯子、內含子上的突變均為單堿基替換型突變。其中位于外顯子上的有3個,位于內含子上的有2個。圖5.不同遺傳背景丹參原引種地點分布圖

本文編號：4056877