馬鈴薯野生種S.pinnatisectum抗晚疫病基因分子作圖及PME/PMEI家族基因表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2025-06-19 05:03
馬鈴薯(Solanum tuberosum L.),屬于茄科(Solanaceae),茄屬(Solanum)馬鈴薯亞屬(Potatoe(G.Don)A'Arcy)馬鈴薯組(Petota Dumortier)。馬鈴薯起源于南美洲安第斯山脈,18世紀(jì)開始在歐洲廣泛傳播,至今已有約160個(gè)國家和地區(qū)種植。中國是世界馬鈴薯生產(chǎn)的第一大國,年種植面積總量和年總產(chǎn)量均位居世界其他國家和地區(qū)的首位。馬鈴薯晚疫病是由致病疫霉菌(Phytophthora infestans)引起的世界性重要病害,具有流行性強(qiáng)、蔓延速度快、致病程度嚴(yán)重等特點(diǎn),被視為馬鈴薯生產(chǎn)的頭號(hào)殺手。致病疫霉菌生理小種毒性不斷變化給馬鈴薯抗病育種帶來巨大困難,抗病基因隨時(shí)面臨抗性喪失的風(fēng)險(xiǎn)。因此,挖掘抗病新種質(zhì)、研究抗病新基因、擴(kuò)展抗病育種資源庫對馬鈴薯抗晚疫病育種具有重要意義。源自墨西哥的馬鈴薯二倍體野生種Solanum pinnatisectum具有優(yōu)良的晚疫病抗性。本研究通過構(gòu)建作圖群體、篩選分子標(biāo)記、共線性分析等手段對S.pinnatisectum無性系PI275233攜帶的抗病基因遺傳機(jī)制進(jìn)行了深入研究;通過晚疫病誘導(dǎo)表達(dá)的轉(zhuǎn)...
【文章頁數(shù)】:121 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 馬鈴薯概況
1.1.1 馬鈴薯分類學(xué)研究進(jìn)展
1.1.2 馬鈴薯栽培歷史
1.1.3 馬鈴薯生產(chǎn)概況
1.2 馬鈴薯晚疫病概況
1.2.1 馬鈴薯晚疫病病原菌—致病疫霉菌
1.2.2 馬鈴薯晚疫病的監(jiān)測與防控
1.3 馬鈴薯抗晚疫病遺傳育種研究概況
1.3.1 馬鈴薯抗晚疫病基因定位及克隆
1.3.2 馬鈴薯抗晚疫病育種進(jìn)展
1.4 馬鈴薯基因組學(xué)研究進(jìn)展
1.4.1 基因組測序與拼接技術(shù)研究進(jìn)展
1.4.2 馬鈴薯基因組高通量測序
1.4.3 基因組學(xué)在馬鈴薯遺傳改良中的應(yīng)用
1.4.4 NBS-LRR基因家族研究進(jìn)展
1.4.5 果膠甲酯酶及其抑制因子(PME/PMEI)基因家族研究進(jìn)展
1.5 本研究的目的及意義
1.6 技術(shù)路線
第二章 馬鈴薯野生種Solanum pinnatisectum抗晚疫病基因Rpi2遺傳圖譜構(gòu)建與共線性分析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 試驗(yàn)材料
2.2.2 試驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 S.pinnatisectum抗病基因遺傳分析
2.3.2 Rpi2分子標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建
2.3.3 Rpi2連鎖區(qū)段共線性分析
2.4 討論
2.4.1 Rpi2與Rpi1間的遺傳關(guān)系
2.4.2 Rpi2位于馬鈴薯7號(hào)染色體的抗病基因熱點(diǎn)區(qū)域
2.4.3 Rpi2區(qū)段序列比較分析
第三章 馬鈴薯基因組果膠甲酯酶及其抑制因子基因鑒定與抗晚疫病表達(dá)分析
3.1 前言
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 StproPME/StPME/StPMEI家族基因鑒定與分類
3.2.2 StproPME/StPME/StPMEI基因家族序列比對及進(jìn)化分析
3.2.3 StproPME/StPME/StPMEI基因結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 StproPMEs基因裂解位點(diǎn)預(yù)測
3.2.5 StproPME/StPME/StPMEI基因染色體定位和基因復(fù)制分析
3.2.6 StproPME/StPME/StPMEI基因不同組織表達(dá)模式分析
3.2.7 StproPME/StPME/StPMEI基因響應(yīng)致病疫霉菌表達(dá)模式分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 StproPME/StPME/StPMEI基因鑒定結(jié)果
3.3.2 StproPME/StPME/StPMEI亞細(xì)胞定位
3.3.3 StproPMEs裂解位點(diǎn)
3.3.4 StproPME/StPME/StPMEI系統(tǒng)發(fā)育及保守基序motif分析
3.3.5 StproPME/StPME/StPMEI基因染色體定位及復(fù)制基因
3.3.6 StproPME/StPME/StPMEI基因表達(dá)模式分析
3.3.7 StproPME/StPME/StPMEI家族內(nèi)成對復(fù)制基因間表達(dá)模式變化研究
3.3.8 致病疫霉菌侵染后StproPME/StPME/StPMEI基因表達(dá)分析
3.4 討論
3.4.1 PMEs/PMEIs與植物生長發(fā)育
3.4.2 PMEs/PMEIs與植物防御反應(yīng)
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡介
本文編號(hào):4050897
【文章頁數(shù)】:121 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 馬鈴薯概況
1.1.1 馬鈴薯分類學(xué)研究進(jìn)展
1.1.2 馬鈴薯栽培歷史
1.1.3 馬鈴薯生產(chǎn)概況
1.2 馬鈴薯晚疫病概況
1.2.1 馬鈴薯晚疫病病原菌—致病疫霉菌
1.2.2 馬鈴薯晚疫病的監(jiān)測與防控
1.3 馬鈴薯抗晚疫病遺傳育種研究概況
1.3.1 馬鈴薯抗晚疫病基因定位及克隆
1.3.2 馬鈴薯抗晚疫病育種進(jìn)展
1.4 馬鈴薯基因組學(xué)研究進(jìn)展
1.4.1 基因組測序與拼接技術(shù)研究進(jìn)展
1.4.2 馬鈴薯基因組高通量測序
1.4.3 基因組學(xué)在馬鈴薯遺傳改良中的應(yīng)用
1.4.4 NBS-LRR基因家族研究進(jìn)展
1.4.5 果膠甲酯酶及其抑制因子(PME/PMEI)基因家族研究進(jìn)展
1.5 本研究的目的及意義
1.6 技術(shù)路線
第二章 馬鈴薯野生種Solanum pinnatisectum抗晚疫病基因Rpi2遺傳圖譜構(gòu)建與共線性分析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 試驗(yàn)材料
2.2.2 試驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 S.pinnatisectum抗病基因遺傳分析
2.3.2 Rpi2分子標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建
2.3.3 Rpi2連鎖區(qū)段共線性分析
2.4 討論
2.4.1 Rpi2與Rpi1間的遺傳關(guān)系
2.4.2 Rpi2位于馬鈴薯7號(hào)染色體的抗病基因熱點(diǎn)區(qū)域
2.4.3 Rpi2區(qū)段序列比較分析
第三章 馬鈴薯基因組果膠甲酯酶及其抑制因子基因鑒定與抗晚疫病表達(dá)分析
3.1 前言
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 StproPME/StPME/StPMEI家族基因鑒定與分類
3.2.2 StproPME/StPME/StPMEI基因家族序列比對及進(jìn)化分析
3.2.3 StproPME/StPME/StPMEI基因結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 StproPMEs基因裂解位點(diǎn)預(yù)測
3.2.5 StproPME/StPME/StPMEI基因染色體定位和基因復(fù)制分析
3.2.6 StproPME/StPME/StPMEI基因不同組織表達(dá)模式分析
3.2.7 StproPME/StPME/StPMEI基因響應(yīng)致病疫霉菌表達(dá)模式分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 StproPME/StPME/StPMEI基因鑒定結(jié)果
3.3.2 StproPME/StPME/StPMEI亞細(xì)胞定位
3.3.3 StproPMEs裂解位點(diǎn)
3.3.4 StproPME/StPME/StPMEI系統(tǒng)發(fā)育及保守基序motif分析
3.3.5 StproPME/StPME/StPMEI基因染色體定位及復(fù)制基因
3.3.6 StproPME/StPME/StPMEI基因表達(dá)模式分析
3.3.7 StproPME/StPME/StPMEI家族內(nèi)成對復(fù)制基因間表達(dá)模式變化研究
3.3.8 致病疫霉菌侵染后StproPME/StPME/StPMEI基因表達(dá)分析
3.4 討論
3.4.1 PMEs/PMEIs與植物生長發(fā)育
3.4.2 PMEs/PMEIs與植物防御反應(yīng)
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡介
本文編號(hào):4050897
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